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Experimental assessment of the importance of amino acid positions identified by an entropy-based correlation analysis of multiple sequence alignments

Dietrich, Susanne und Borst, Nadine und Schlee, Sandra und Schneider, Daniel und Janda, Jan-Oliver und Sterner, Reinhard und Merkl, Rainer (2012) Experimental assessment of the importance of amino acid positions identified by an entropy-based correlation analysis of multiple sequence alignments. Biochemistry.

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Zusammenfassung

The analysis of a multiple sequence alignment (MSA) with correlation methods identifies for a protein pairs of residue-positions whose occupation with amino acids change in a concerted manner. It is plausible to assume that positions that are a member of many such correlation pairs are important for protein function or stability. We have used the algorithm H2r to identify positions k in the MSAs ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:27 Juni 2012
Institutionen:Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Rainer Merkl
Identifikationsnummer:
WertTyp
22737967PubMed-ID
10.1021/bi300747rDOI
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
000 Informatik, Informationswissenschaft, allgemeine Werke > 004 Informatik
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Eingebracht am:09 Jul 2012 14:11
Zuletzt geändert:09 Jul 2012 14:14
Dokumenten-ID:25302
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