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3D protein structures 5’-Deoxy-5’-methylthioadenosine (MTA) Acute kidney injury (AKI) AGO2 alignment Animal proteomics AP-1 apoptosis Arabidopsis artificial neural network Bayesian network learning BGe score bioinformatics bioninformatics Blood plasma BRCA1 BRCA2 Breast cancer risk c-Jun Cancer CDH2 cJun Classification Clinical allogeneic transplantation Comprehensive two-dimensional gas chromatography electron ionization time-of-flight mass spectrometry (GC×GC-EI-TOFMS) computer program Crohn's Disease dairy cows data mining Datenauswertung dendritic cell diclofenac DLBCL Docking EF-1A EHHADH Enantioselective analysis Fanconi´s syndrome Fatty acid methyl esters Fingerprinting Flüssigchromatographie-Tandemmassenspektrometrie Gas Chromatographie Gas chromatography gas chromatography−mass spectrometry Gaussian DAG models GC × GC–TOFMS GC-MS genetic association study glioma glucose GVHD HADDOCK Hereditary breast and ovarian cancer heterogeneity hidden variables hnRNP K IFN Immune Regulation Ionic liquid columns ketosis lactate LDH-A lifestyle factors liquid chromatography-tandem mass spectrometry Liver proteome Lymphoma major facilitator superfamily malignant melanoma MAP 3-kinase MAPK/ERK signalling Mass spectrometry Massenspektrometrie Melanoma metabolic fingerprinting metabolic syndrome metabolite profiling metabolites metabolomics Metabolomics GC-MS Adherent cells Detachment Extraction Amino acids Metabolomik Metagenomics Methionin- und Polyaminstoffwechselwege methionine and polyamine pathways methods Methyl chloroformate Methylthioadenosine methythioadenosine phosphorylase (MTAP) microarray Microbiome milk milk metabolite milk metabolomics miRNA mitochondriopathy NAFLD NASH Network reconstruction NMR NMR spectroscopy Nonalcoholic fatty liver disease Nonalcoholic steatohepatitis nuclear magnetic resonance Organic acids ovarian cancer Penetrance of BRCA2 plasma prediction preneoplastic changes Primary cells PRMT PROCOS profiling prophylactic salpingo-oophorectomy Protein arginine methylation protein-protein docking protein-protein-complexes quantification Raf kinases regulatory T cell Retention crossover RNAi rs11564299 scoring Serum shRNA signal transduction siRNA SOCS1 mutation Spike-in experiment Stat3 statistical data analysis TLR transport Tumor cells Two-dimensional differential in-gel electrophoresis ubiquitin Ulcerative Colitis Umfassende 2-dimensionale Gas Chromatographie gekoppelt mit der Flugzeitmassenspektrometrie Urine vacuole verification of protein interactions
Anzahl der Einträge in dieser Kategorie: 172.

3D protein structures

Fink, Florian und Ederer, Stephan und Gronwald, Wolfram (2009) Protein-Protein Interaction Analysis by Docking. Algorithms 2 (1), S. 429-436.

5’-Deoxy-5’-methylthioadenosine (MTA)

Stevens, Axel Peter (2011) Analysis of intermediates of the methionine and polyamine metabolism by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Dissertation, Universität Regensburg

Acute kidney injury (AKI)

Zacharias, Helena und Schley, Gunnar und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Köberle, Carmen und Eckardt, Kai-Uwe und Willam, Carsten und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Analysis of human urine reveals metabolic changes related to the development of acute kidney injury following cardiac surgery. Metabolomics 9 (3), S. 697-707.

AGO2

Völler, D. und Reinders, Jörg und Meister, Gunter und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Strong reduction of AGO2 expression in melanoma and cellular consequences. British Journal of Cancer 109, S. 3116-3124.

alignment

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Dettmer, Katja und Gruber, Michael und Oefner, Peter J. (2011) Comparison of two algorithmic data processing strategies for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (39), S. 7031-7038.

Animal proteomics

Thomas, Anja und Stevens, Axel Peter und Klein, Matthias S. und Hellerbrand, Claus und Dettmer, Katja und Gronwald, Wolfram und Oefner, Peter J. und Reinders, Jörg (2012) Early changes in the liver-soluble proteome from mice fed a nonalcoholic steatohepatitis inducing diet. Proteomics 12 (9), S. 1437-1451.

AP-1

Dorn, Christoph und Engelmann, Julia C. und Saugspier, Michael Sebastian und Koch, Andreas und Hartmann, Arndt und Spang, Rainer und Bosserhoff, Anja Katrin und Hellerbrand, Claus (2014) Increased expression of c-Jun in nonalcoholic fatty liver disease. Laboratory Investigation 94, S. 394-408.

apoptosis

Sanges, C. und Scheuermann, C. und Zahedi, R. P. und Sickmann, A. und Lamberti, A. und Migliaccio, N. und Baljuls, A. und Marra, M. und Zappavigna, S. und Reinders, Jörg und Rapp, U. und Abbruzzese, A. und Caraglia, M. und Arcari, P. (2012) Raf kinases mediate the phosphorylation of eukaryotic translation elongation factor 1A and regulate its stability in eukaryotic cells. Cell Death and Disease 3, e276.

Arabidopsis

Wingenter, Karina und Trentmann, Oliver und Winschuh, Irina und Hörmiller, Imke I und Heyer, Arnd G. und Reinders, Jörg und Schulz, Alexander und Geiger, Dietmar und Hedrich, Rainer und Neuhaus, H. Ekkehard (2011) A member of the mitogen-activated protein 3-kinase family is involved in the regulation of plant vacuolar glucose uptake. The Plant journal 68 (5), S. 890-900.

artificial neural network

Ehret, A. und Hochstuhl, D. und Krattenmacher, N. und Tetens, J. und Klein, M. S. und Gronwald, Wolfram und Thaller, G. (2015) Short communication: Use of genomic and metabolic information as well as milk performance records for prediction of subclinical ketosis risk via artificial neural networks. Journal of dairy science 98 (1), S. 322-329.

Bayesian network learning

Kuipers, Jack und Moffa, Giusi und Heckerman, David (2014) Addendum on the scoring of Gaussian directed acyclic graphical models. Annals of Statistics. (Im Druck)

BGe score

Kuipers, Jack und Moffa, Giusi und Heckerman, David (2014) Addendum on the scoring of Gaussian directed acyclic graphical models. Annals of Statistics. (Im Druck)

bioinformatics

Fink, Florian (2011) Computational analysis of docked protein-protein complexes. Dissertation, Universität Regensburg

bioninformatics

Meyer, Katharina (2013) Dissolving heterogeneity in cancer. Dissertation, Universität Regensburg

Blood plasma

Dettmer, Katja und Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Nürnberger, Nadine und Schlamberger, Gregor und Gronwald, Wolfram und Meyer, Heinrich H. D. und Oefner, Peter J. (2010) Comparison of serum versus plasma collection in gas chromatography--mass spectrometry-based metabolomics. Electrophoresis 31 (14), S. 2365-2373.

BRCA1

Primas, Helga und Kroiss, Regina und Kalteis, Karin und Rappaport, Christine und Muhr, Daniela und Primas, Christian und Kubista, Ernst und Horvat, Reinhard und Oefner, Peter J. und Singer, Christian F. und Wagner, Teresa (2012) Impact of lifestyle factors on preneoplastic changes in prophylactic oophorectomies of BRCA mutation carriers. European journal of cancer prevention : the official journal of the European Cancer Prevention Organisation (ECP) 21 (2), S. 199-204.

BRCA2

Tea, Muy-Kheng M. und Kroiss, Regina und Muhr, Daniela und Fuerhauser-Rappaport, Christine und Oefner, Peter J. und Wagner, Teresa M und Singer, Christian F. (2013) Central European BRCA2 mutation carriers: Birth cohort status correlates with onset of breast cancer. Maturitas.

Primas, Helga und Kroiss, Regina und Kalteis, Karin und Rappaport, Christine und Muhr, Daniela und Primas, Christian und Kubista, Ernst und Horvat, Reinhard und Oefner, Peter J. und Singer, Christian F. und Wagner, Teresa (2012) Impact of lifestyle factors on preneoplastic changes in prophylactic oophorectomies of BRCA mutation carriers. European journal of cancer prevention : the official journal of the European Cancer Prevention Organisation (ECP) 21 (2), S. 199-204.

Breast cancer risk

Tea, Muy-Kheng M. und Kroiss, Regina und Muhr, Daniela und Fuerhauser-Rappaport, Christine und Oefner, Peter J. und Wagner, Teresa M und Singer, Christian F. (2013) Central European BRCA2 mutation carriers: Birth cohort status correlates with onset of breast cancer. Maturitas.

c-Jun

Dorn, Christoph und Engelmann, Julia C. und Saugspier, Michael Sebastian und Koch, Andreas und Hartmann, Arndt und Spang, Rainer und Bosserhoff, Anja Katrin und Hellerbrand, Claus (2014) Increased expression of c-Jun in nonalcoholic fatty liver disease. Laboratory Investigation 94, S. 394-408.

Cancer

Meyer, Katharina (2013) Dissolving heterogeneity in cancer. Dissertation, Universität Regensburg

CDH2

Ruedel, Anke und Stark, Klaus und Kaufmann, Simone und Bauer, Richard und Reinders, Jörg und Rovensky, Jozef und Blazicková, Stanislava und Oefner, Peter J. und Bosserhoff, Anja Katrin (2014) N-cadherin promoter polymorphisms and risk of osteoarthritis. FASEB journal 28 (2), S. 683-691.

cJun

Völler, D. und Reinders, Jörg und Meister, Gunter und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Strong reduction of AGO2 expression in melanoma and cellular consequences. British Journal of Cancer 109, S. 3116-3124.

Classification

Zacharias, Helena und Schley, Gunnar und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Köberle, Carmen und Eckardt, Kai-Uwe und Willam, Carsten und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Analysis of human urine reveals metabolic changes related to the development of acute kidney injury following cardiac surgery. Metabolomics 9 (3), S. 697-707.

Clinical allogeneic transplantation

Holler, Ernst und Butzhammer, Peter und Schmid, Karin und Hundsrucker, Christian und Koestler, Josef und Peter, Katrin und Zhu, Wentao und Sporrer, Daniela und Hehlgans, Thomas und Kreutz, Marina und Holler, Barbara und Wolff, Daniel und Edinger, Matthias und Andreesen, Reinhard und Levine, John E. und Ferrara, James L und Gessner, Andre und Spang, Rainer und Oefner, Peter J. (2014) Metagenomic analysis of the stool microbiome in patients receiving allogeneic SCT: Loss of diversity is associated with use of systemic antibiotics and more pronounced in gastrointestinal GvHD. Biology of Blood and Marrow Transplantation 20 (5), S. 640-645.

Comprehensive two-dimensional gas chromatography electron ionization time-of-flight mass spectrometry (GC×GC-EI-TOFMS)

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

computer program

Klein, Matthias S. und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) MetaboQuant: a tool combining individual peak calibration and outlier detection for accurate metabolite quantification in 1D (1)H and (1)H-(13)C HSQC NMR spectra. BioTechniques 54 (5), S. 251-256.

Crohn's Disease

Vossenkämper, Anna und Hundsrucker, Christian und Page, Kevin und van Maurik, Andre und Sanders, Theodore J. und Stagg, Andrew J. und Das, Lisa und MacDonald, Thomas T. (2014) A CD3-Specific Antibody Reduces Cytokine Production and Alters Phosphoprotein Profiles in Intestinal Tissues From Patients With Inflammatory Bowel Disease. The American Journal of Gastroenterology 147 (1), S. 172-183.

dairy cows

Klein, Matthias S. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Sigl, Gregor und Gronwald, Wolfram und Wiedemann, Steffi und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2013) Correlations between milk and plasma levels of amino and carboxylic acids in dairy cows. Journal of Proteome Research 12 (11), S. 5223-5232.

data mining

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Dettmer, Katja und Gruber, Michael und Oefner, Peter J. (2011) Comparison of two algorithmic data processing strategies for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (39), S. 7031-7038.

Datenauswertung

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

dendritic cell

Chirasani, Sridhar Reddy und Leukel, Petra und Gottfried, Eva und Hochrein, Jochen und Stadler, Katrin und Neumann, Bernhard und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Bogdahn, Ulrich und Hau, Peter und Kreutz, Marina und Grauer, Oliver M. (2013) Diclofenac inhibits lactate formation and efficiently counteracts local immune suppression in a murine glioma model. International journal of cancer. Journal international du cancer 132 (4), S. 843-53.

diclofenac

Chirasani, Sridhar Reddy und Leukel, Petra und Gottfried, Eva und Hochrein, Jochen und Stadler, Katrin und Neumann, Bernhard und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Bogdahn, Ulrich und Hau, Peter und Kreutz, Marina und Grauer, Oliver M. (2013) Diclofenac inhibits lactate formation and efficiently counteracts local immune suppression in a murine glioma model. International journal of cancer. Journal international du cancer 132 (4), S. 843-53.

DLBCL

Schif, Birgit und Lennerz, Jochen K. und Kohler, Christian und Bentink, Stefan und Kreuz, Markus und Melzner, Ingo und Ritz, Olga und Trümper, Lorenz und Loeffler, Markus und Spang, Rainer und Möller, Peter (2013) SOCS1 mutation subtypes predict divergent outcomes in diffuse large B-Cell lymphoma (DLBCL) patients. Oncotarget 4 (1), S. 35-47.

Docking

Fink, Florian (2011) Computational analysis of docked protein-protein complexes. Dissertation, Universität Regensburg

EF-1A

Sanges, C. und Scheuermann, C. und Zahedi, R. P. und Sickmann, A. und Lamberti, A. und Migliaccio, N. und Baljuls, A. und Marra, M. und Zappavigna, S. und Reinders, Jörg und Rapp, U. und Abbruzzese, A. und Caraglia, M. und Arcari, P. (2012) Raf kinases mediate the phosphorylation of eukaryotic translation elongation factor 1A and regulate its stability in eukaryotic cells. Cell Death and Disease 3, e276.

EHHADH

Aßmann, Nadine (2015) Impact of Fanconi-associated protein on the mitochondrial proteome. Dissertation, Universität Regensburg

Enantioselective analysis

Waldhier, Magdalena Ch. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Gruber, Michael und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2011) Improved enantiomer resolution and quantification of free D-amino acids in serum and urine by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (28), S. 4537-4544.

Fanconi´s syndrome

Aßmann, Nadine (2015) Impact of Fanconi-associated protein on the mitochondrial proteome. Dissertation, Universität Regensburg

Fatty acid methyl esters

Dettmer, Katja (2014) Assessment of ionic liquid stationary phases for the GC analysis of fatty acid methyl esters. Analytical and Bioanalytical Chemistry 406, S. 4931-4939.

Fingerprinting

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics Volume 1 (# 3), S. 253-268.

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics 1 (3), S. 253-268.

Flüssigchromatographie-Tandemmassenspektrometrie

Stevens, Axel Peter (2011) Analysis of intermediates of the methionine and polyamine metabolism by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Dissertation, Universität Regensburg

Gas Chromatographie

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

Gas chromatography

Dettmer, Katja (2014) Assessment of ionic liquid stationary phases for the GC analysis of fatty acid methyl esters. Analytical and Bioanalytical Chemistry 406, S. 4931-4939.

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

gas chromatography−mass spectrometry

Klein, Matthias S. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Sigl, Gregor und Gronwald, Wolfram und Wiedemann, Steffi und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2013) Correlations between milk and plasma levels of amino and carboxylic acids in dairy cows. Journal of Proteome Research 12 (11), S. 5223-5232.

Gaussian DAG models

Kuipers, Jack und Moffa, Giusi und Heckerman, David (2014) Addendum on the scoring of Gaussian directed acyclic graphical models. Annals of Statistics. (Im Druck)

GC × GC–TOFMS

Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Dettmer, Katja und Gruber, Michael und Oefner, Peter J. (2011) Comparison of two algorithmic data processing strategies for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (39), S. 7031-7038.

Waldhier, Magdalena Ch. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Gruber, Michael und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2011) Improved enantiomer resolution and quantification of free D-amino acids in serum and urine by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (28), S. 4537-4544.

GC-MS

Dettmer, Katja und Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Nürnberger, Nadine und Schlamberger, Gregor und Gronwald, Wolfram und Meyer, Heinrich H. D. und Oefner, Peter J. (2010) Comparison of serum versus plasma collection in gas chromatography--mass spectrometry-based metabolomics. Electrophoresis 31 (14), S. 2365-2373.

genetic association study

Ruedel, Anke und Stark, Klaus und Kaufmann, Simone und Bauer, Richard und Reinders, Jörg und Rovensky, Jozef und Blazicková, Stanislava und Oefner, Peter J. und Bosserhoff, Anja Katrin (2014) N-cadherin promoter polymorphisms and risk of osteoarthritis. FASEB journal 28 (2), S. 683-691.

glioma

Chirasani, Sridhar Reddy und Leukel, Petra und Gottfried, Eva und Hochrein, Jochen und Stadler, Katrin und Neumann, Bernhard und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Bogdahn, Ulrich und Hau, Peter und Kreutz, Marina und Grauer, Oliver M. (2013) Diclofenac inhibits lactate formation and efficiently counteracts local immune suppression in a murine glioma model. International journal of cancer. Journal international du cancer 132 (4), S. 843-53.

glucose

Wingenter, Karina und Trentmann, Oliver und Winschuh, Irina und Hörmiller, Imke I und Heyer, Arnd G. und Reinders, Jörg und Schulz, Alexander und Geiger, Dietmar und Hedrich, Rainer und Neuhaus, H. Ekkehard (2011) A member of the mitogen-activated protein 3-kinase family is involved in the regulation of plant vacuolar glucose uptake. The Plant journal 68 (5), S. 890-900.

GVHD

Holler, Ernst und Butzhammer, Peter und Schmid, Karin und Hundsrucker, Christian und Koestler, Josef und Peter, Katrin und Zhu, Wentao und Sporrer, Daniela und Hehlgans, Thomas und Kreutz, Marina und Holler, Barbara und Wolff, Daniel und Edinger, Matthias und Andreesen, Reinhard und Levine, John E. und Ferrara, James L und Gessner, Andre und Spang, Rainer und Oefner, Peter J. (2014) Metagenomic analysis of the stool microbiome in patients receiving allogeneic SCT: Loss of diversity is associated with use of systemic antibiotics and more pronounced in gastrointestinal GvHD. Biology of Blood and Marrow Transplantation 20 (5), S. 640-645.

HADDOCK

Fink, Florian (2011) Computational analysis of docked protein-protein complexes. Dissertation, Universität Regensburg

Hereditary breast and ovarian cancer

Tea, Muy-Kheng M. und Kroiss, Regina und Muhr, Daniela und Fuerhauser-Rappaport, Christine und Oefner, Peter J. und Wagner, Teresa M und Singer, Christian F. (2013) Central European BRCA2 mutation carriers: Birth cohort status correlates with onset of breast cancer. Maturitas.

heterogeneity

Meyer, Katharina (2013) Dissolving heterogeneity in cancer. Dissertation, Universität Regensburg

hidden variables

Sadeh, Mohammad Javad (2013) Considering unknown unknown: reconstruction of non-confoundable causal relations in biological networks. Dissertation, Universität Regensburg

hnRNP K

Ruedel, Anke und Stark, Klaus und Kaufmann, Simone und Bauer, Richard und Reinders, Jörg und Rovensky, Jozef und Blazicková, Stanislava und Oefner, Peter J. und Bosserhoff, Anja Katrin (2014) N-cadherin promoter polymorphisms and risk of osteoarthritis. FASEB journal 28 (2), S. 683-691.

IFN

Vossenkämper, Anna und Hundsrucker, Christian und Page, Kevin und van Maurik, Andre und Sanders, Theodore J. und Stagg, Andrew J. und Das, Lisa und MacDonald, Thomas T. (2014) A CD3-Specific Antibody Reduces Cytokine Production and Alters Phosphoprotein Profiles in Intestinal Tissues From Patients With Inflammatory Bowel Disease. The American Journal of Gastroenterology 147 (1), S. 172-183.

Immune Regulation

Vossenkämper, Anna und Hundsrucker, Christian und Page, Kevin und van Maurik, Andre und Sanders, Theodore J. und Stagg, Andrew J. und Das, Lisa und MacDonald, Thomas T. (2014) A CD3-Specific Antibody Reduces Cytokine Production and Alters Phosphoprotein Profiles in Intestinal Tissues From Patients With Inflammatory Bowel Disease. The American Journal of Gastroenterology 147 (1), S. 172-183.

Ionic liquid columns

Dettmer, Katja (2014) Assessment of ionic liquid stationary phases for the GC analysis of fatty acid methyl esters. Analytical and Bioanalytical Chemistry 406, S. 4931-4939.

ketosis

Ehret, A. und Hochstuhl, D. und Krattenmacher, N. und Tetens, J. und Klein, M. S. und Gronwald, Wolfram und Thaller, G. (2015) Short communication: Use of genomic and metabolic information as well as milk performance records for prediction of subclinical ketosis risk via artificial neural networks. Journal of dairy science 98 (1), S. 322-329.

lactate

Chirasani, Sridhar Reddy und Leukel, Petra und Gottfried, Eva und Hochrein, Jochen und Stadler, Katrin und Neumann, Bernhard und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Bogdahn, Ulrich und Hau, Peter und Kreutz, Marina und Grauer, Oliver M. (2013) Diclofenac inhibits lactate formation and efficiently counteracts local immune suppression in a murine glioma model. International journal of cancer. Journal international du cancer 132 (4), S. 843-53.

LDH-A

Chirasani, Sridhar Reddy und Leukel, Petra und Gottfried, Eva und Hochrein, Jochen und Stadler, Katrin und Neumann, Bernhard und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Bogdahn, Ulrich und Hau, Peter und Kreutz, Marina und Grauer, Oliver M. (2013) Diclofenac inhibits lactate formation and efficiently counteracts local immune suppression in a murine glioma model. International journal of cancer. Journal international du cancer 132 (4), S. 843-53.

lifestyle factors

Primas, Helga und Kroiss, Regina und Kalteis, Karin und Rappaport, Christine und Muhr, Daniela und Primas, Christian und Kubista, Ernst und Horvat, Reinhard und Oefner, Peter J. und Singer, Christian F. und Wagner, Teresa (2012) Impact of lifestyle factors on preneoplastic changes in prophylactic oophorectomies of BRCA mutation carriers. European journal of cancer prevention : the official journal of the European Cancer Prevention Organisation (ECP) 21 (2), S. 199-204.

liquid chromatography-tandem mass spectrometry

Stevens, Axel Peter (2011) Analysis of intermediates of the methionine and polyamine metabolism by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Dissertation, Universität Regensburg

Liver proteome

Thomas, Anja und Stevens, Axel Peter und Klein, Matthias S. und Hellerbrand, Claus und Dettmer, Katja und Gronwald, Wolfram und Oefner, Peter J. und Reinders, Jörg (2012) Early changes in the liver-soluble proteome from mice fed a nonalcoholic steatohepatitis inducing diet. Proteomics 12 (9), S. 1437-1451.

Lymphoma

Schif, Birgit und Lennerz, Jochen K. und Kohler, Christian und Bentink, Stefan und Kreuz, Markus und Melzner, Ingo und Ritz, Olga und Trümper, Lorenz und Loeffler, Markus und Spang, Rainer und Möller, Peter (2013) SOCS1 mutation subtypes predict divergent outcomes in diffuse large B-Cell lymphoma (DLBCL) patients. Oncotarget 4 (1), S. 35-47.

major facilitator superfamily

Wingenter, Karina und Trentmann, Oliver und Winschuh, Irina und Hörmiller, Imke I und Heyer, Arnd G. und Reinders, Jörg und Schulz, Alexander und Geiger, Dietmar und Hedrich, Rainer und Neuhaus, H. Ekkehard (2011) A member of the mitogen-activated protein 3-kinase family is involved in the regulation of plant vacuolar glucose uptake. The Plant journal 68 (5), S. 890-900.

malignant melanoma

Völler, D. und Reinders, Jörg und Meister, Gunter und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Strong reduction of AGO2 expression in melanoma and cellular consequences. British Journal of Cancer 109, S. 3116-3124.

MAP 3-kinase

Wingenter, Karina und Trentmann, Oliver und Winschuh, Irina und Hörmiller, Imke I und Heyer, Arnd G. und Reinders, Jörg und Schulz, Alexander und Geiger, Dietmar und Hedrich, Rainer und Neuhaus, H. Ekkehard (2011) A member of the mitogen-activated protein 3-kinase family is involved in the regulation of plant vacuolar glucose uptake. The Plant journal 68 (5), S. 890-900.

MAPK/ERK signalling

Limm, Katharina und Ott, Corinna und Wallner, Susanne und Mueller, Daniel W. und Oefner, Peter J. und Hellerbrand, Claus und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Deregulation of protein methylation in melanoma. European journal of cancer 49 (6), S. 1305-1313.

Mass spectrometry

Dettmer, Katja und Vogl, Franziska C. und Ritter, Axel P. und Zhu, Wentao und Nürnberger, Nadine und Kreutz, Marina und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Gottfried, Eva (2013) Distinct metabolic differences between various human cancer and primary cells. ELECTROPHORESIS 34 (19), S. 2836-2847.

Sanges, C. und Scheuermann, C. und Zahedi, R. P. und Sickmann, A. und Lamberti, A. und Migliaccio, N. und Baljuls, A. und Marra, M. und Zappavigna, S. und Reinders, Jörg und Rapp, U. und Abbruzzese, A. und Caraglia, M. und Arcari, P. (2012) Raf kinases mediate the phosphorylation of eukaryotic translation elongation factor 1A and regulate its stability in eukaryotic cells. Cell Death and Disease 3, e276.

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

Klein, Matthias S. und Almstetter, Martin F. und Schlamberger, G. und Nürnberger, Nadine und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. und Meyer, H. H. D. und Wiedemann, Steffi und Gronwald, Wolfram (2010) Nuclear magnetic resonance and mass spectrometry-based milk metabolomics in dairy cows during early and late lactation. Journal of dairy science 93 (4), S. 1539-1550.

Massenspektrometrie

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

Melanoma

Limm, Katharina und Ott, Corinna und Wallner, Susanne und Mueller, Daniel W. und Oefner, Peter J. und Hellerbrand, Claus und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Deregulation of protein methylation in melanoma. European journal of cancer 49 (6), S. 1305-1313.

metabolic fingerprinting

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Dettmer, Katja und Gruber, Michael und Oefner, Peter J. (2011) Comparison of two algorithmic data processing strategies for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (39), S. 7031-7038.

metabolic syndrome

Dorn, Christoph und Engelmann, Julia C. und Saugspier, Michael Sebastian und Koch, Andreas und Hartmann, Arndt und Spang, Rainer und Bosserhoff, Anja Katrin und Hellerbrand, Claus (2014) Increased expression of c-Jun in nonalcoholic fatty liver disease. Laboratory Investigation 94, S. 394-408.

metabolite profiling

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

metabolites

Klein, Matthias S. und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) MetaboQuant: a tool combining individual peak calibration and outlier detection for accurate metabolite quantification in 1D (1)H and (1)H-(13)C HSQC NMR spectra. BioTechniques 54 (5), S. 251-256.

metabolomics

Klein, Matthias S. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Sigl, Gregor und Gronwald, Wolfram und Wiedemann, Steffi und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2013) Correlations between milk and plasma levels of amino and carboxylic acids in dairy cows. Journal of Proteome Research 12 (11), S. 5223-5232.

Dettmer, Katja und Vogl, Franziska C. und Ritter, Axel P. und Zhu, Wentao und Nürnberger, Nadine und Kreutz, Marina und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Gottfried, Eva (2013) Distinct metabolic differences between various human cancer and primary cells. ELECTROPHORESIS 34 (19), S. 2836-2847.

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics Volume 1 (# 3), S. 253-268.

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics 1 (3), S. 253-268.

Zacharias, Helena und Schley, Gunnar und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Köberle, Carmen und Eckardt, Kai-Uwe und Willam, Carsten und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Analysis of human urine reveals metabolic changes related to the development of acute kidney injury following cardiac surgery. Metabolomics 9 (3), S. 697-707.

Thomas, Anja und Stevens, Axel Peter und Klein, Matthias S. und Hellerbrand, Claus und Dettmer, Katja und Gronwald, Wolfram und Oefner, Peter J. und Reinders, Jörg (2012) Early changes in the liver-soluble proteome from mice fed a nonalcoholic steatohepatitis inducing diet. Proteomics 12 (9), S. 1437-1451.

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Dettmer, Katja und Gruber, Michael und Oefner, Peter J. (2011) Comparison of two algorithmic data processing strategies for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (39), S. 7031-7038.

Stevens, Axel Peter (2011) Analysis of intermediates of the methionine and polyamine metabolism by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Dissertation, Universität Regensburg

Stevens, Axel Peter (2011) Analysis of intermediates of the methionine and polyamine metabolism by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Dissertation, Universität Regensburg

Waldhier, Magdalena Ch. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Gruber, Michael und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2011) Improved enantiomer resolution and quantification of free D-amino acids in serum and urine by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (28), S. 4537-4544.

Klein, Matthias S. und Dorn, Christoph und Saugspier, Michael Sebastian und Hellerbrand, Claus und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2011) Discrimination of steatosis and NASH in mice using nuclear magnetic resonance spectroscopy. Metabolomics 7 (2), S. 237-246.

Dettmer, Katja und Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Nürnberger, Nadine und Schlamberger, Gregor und Gronwald, Wolfram und Meyer, Heinrich H. D. und Oefner, Peter J. (2010) Comparison of serum versus plasma collection in gas chromatography--mass spectrometry-based metabolomics. Electrophoresis 31 (14), S. 2365-2373.

Metabolomics GC-MS Adherent cells Detachment Extraction Amino acids

Dettmer, Katja und Nürnberger, Nadine und Kaspar, Hannelore und Gruber, Michael und Almstetter, Martin F. und Oefner, Peter J. (2011) Metabolite extraction from adherently growing mammalian cells for metabolomics studies: optimization of harvesting and extraction protocols. Analytical and bioanalytical chemistry 399 (3), S. 1127-1139.

Metabolomik

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

Metagenomics

Holler, Ernst und Butzhammer, Peter und Schmid, Karin und Hundsrucker, Christian und Koestler, Josef und Peter, Katrin und Zhu, Wentao und Sporrer, Daniela und Hehlgans, Thomas und Kreutz, Marina und Holler, Barbara und Wolff, Daniel und Edinger, Matthias und Andreesen, Reinhard und Levine, John E. und Ferrara, James L und Gessner, Andre und Spang, Rainer und Oefner, Peter J. (2014) Metagenomic analysis of the stool microbiome in patients receiving allogeneic SCT: Loss of diversity is associated with use of systemic antibiotics and more pronounced in gastrointestinal GvHD. Biology of Blood and Marrow Transplantation 20 (5), S. 640-645.

Methionin- und Polyaminstoffwechselwege

Stevens, Axel Peter (2011) Analysis of intermediates of the methionine and polyamine metabolism by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Dissertation, Universität Regensburg

methionine and polyamine pathways

Stevens, Axel Peter (2011) Analysis of intermediates of the methionine and polyamine metabolism by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Dissertation, Universität Regensburg

methods

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics Volume 1 (# 3), S. 253-268.

Methyl chloroformate

Waldhier, Magdalena Ch. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Gruber, Michael und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2011) Improved enantiomer resolution and quantification of free D-amino acids in serum and urine by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (28), S. 4537-4544.

Methylthioadenosine

Limm, Katharina und Ott, Corinna und Wallner, Susanne und Mueller, Daniel W. und Oefner, Peter J. und Hellerbrand, Claus und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Deregulation of protein methylation in melanoma. European journal of cancer 49 (6), S. 1305-1313.

methythioadenosine phosphorylase (MTAP)

Stevens, Axel Peter (2011) Analysis of intermediates of the methionine and polyamine metabolism by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Dissertation, Universität Regensburg

microarray

Meyer, Katharina (2013) Dissolving heterogeneity in cancer. Dissertation, Universität Regensburg

Microbiome

Holler, Ernst und Butzhammer, Peter und Schmid, Karin und Hundsrucker, Christian und Koestler, Josef und Peter, Katrin und Zhu, Wentao und Sporrer, Daniela und Hehlgans, Thomas und Kreutz, Marina und Holler, Barbara und Wolff, Daniel und Edinger, Matthias und Andreesen, Reinhard und Levine, John E. und Ferrara, James L und Gessner, Andre und Spang, Rainer und Oefner, Peter J. (2014) Metagenomic analysis of the stool microbiome in patients receiving allogeneic SCT: Loss of diversity is associated with use of systemic antibiotics and more pronounced in gastrointestinal GvHD. Biology of Blood and Marrow Transplantation 20 (5), S. 640-645.

milk

Klein, Matthias S. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Sigl, Gregor und Gronwald, Wolfram und Wiedemann, Steffi und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2013) Correlations between milk and plasma levels of amino and carboxylic acids in dairy cows. Journal of Proteome Research 12 (11), S. 5223-5232.

milk metabolite

Ehret, A. und Hochstuhl, D. und Krattenmacher, N. und Tetens, J. und Klein, M. S. und Gronwald, Wolfram und Thaller, G. (2015) Short communication: Use of genomic and metabolic information as well as milk performance records for prediction of subclinical ketosis risk via artificial neural networks. Journal of dairy science 98 (1), S. 322-329.

milk metabolomics

Klein, Matthias S. und Almstetter, Martin F. und Schlamberger, G. und Nürnberger, Nadine und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. und Meyer, H. H. D. und Wiedemann, Steffi und Gronwald, Wolfram (2010) Nuclear magnetic resonance and mass spectrometry-based milk metabolomics in dairy cows during early and late lactation. Journal of dairy science 93 (4), S. 1539-1550.

miRNA

Völler, D. und Reinders, Jörg und Meister, Gunter und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Strong reduction of AGO2 expression in melanoma and cellular consequences. British Journal of Cancer 109, S. 3116-3124.

mitochondriopathy

Aßmann, Nadine (2015) Impact of Fanconi-associated protein on the mitochondrial proteome. Dissertation, Universität Regensburg

NAFLD

Dorn, Christoph und Engelmann, Julia C. und Saugspier, Michael Sebastian und Koch, Andreas und Hartmann, Arndt und Spang, Rainer und Bosserhoff, Anja Katrin und Hellerbrand, Claus (2014) Increased expression of c-Jun in nonalcoholic fatty liver disease. Laboratory Investigation 94, S. 394-408.

NASH

Dorn, Christoph und Engelmann, Julia C. und Saugspier, Michael Sebastian und Koch, Andreas und Hartmann, Arndt und Spang, Rainer und Bosserhoff, Anja Katrin und Hellerbrand, Claus (2014) Increased expression of c-Jun in nonalcoholic fatty liver disease. Laboratory Investigation 94, S. 394-408.

Network reconstruction

Sadeh, Mohammad Javad (2013) Considering unknown unknown: reconstruction of non-confoundable causal relations in biological networks. Dissertation, Universität Regensburg

NMR

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics Volume 1 (# 3), S. 253-268.

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics 1 (3), S. 253-268.

Klein, Matthias S. und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) MetaboQuant: a tool combining individual peak calibration and outlier detection for accurate metabolite quantification in 1D (1)H and (1)H-(13)C HSQC NMR spectra. BioTechniques 54 (5), S. 251-256.

Klein, Matthias S. und Dorn, Christoph und Saugspier, Michael Sebastian und Hellerbrand, Claus und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2011) Discrimination of steatosis and NASH in mice using nuclear magnetic resonance spectroscopy. Metabolomics 7 (2), S. 237-246.

NMR spectroscopy

Zacharias, Helena und Schley, Gunnar und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Köberle, Carmen und Eckardt, Kai-Uwe und Willam, Carsten und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Analysis of human urine reveals metabolic changes related to the development of acute kidney injury following cardiac surgery. Metabolomics 9 (3), S. 697-707.

Nonalcoholic fatty liver disease

Klein, Matthias S. und Dorn, Christoph und Saugspier, Michael Sebastian und Hellerbrand, Claus und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2011) Discrimination of steatosis and NASH in mice using nuclear magnetic resonance spectroscopy. Metabolomics 7 (2), S. 237-246.

Nonalcoholic steatohepatitis

Thomas, Anja und Stevens, Axel Peter und Klein, Matthias S. und Hellerbrand, Claus und Dettmer, Katja und Gronwald, Wolfram und Oefner, Peter J. und Reinders, Jörg (2012) Early changes in the liver-soluble proteome from mice fed a nonalcoholic steatohepatitis inducing diet. Proteomics 12 (9), S. 1437-1451.

nuclear magnetic resonance

Klein, Matthias S. und Almstetter, Martin F. und Schlamberger, G. und Nürnberger, Nadine und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. und Meyer, H. H. D. und Wiedemann, Steffi und Gronwald, Wolfram (2010) Nuclear magnetic resonance and mass spectrometry-based milk metabolomics in dairy cows during early and late lactation. Journal of dairy science 93 (4), S. 1539-1550.

Organic acids

Dettmer, Katja und Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Nürnberger, Nadine und Schlamberger, Gregor und Gronwald, Wolfram und Meyer, Heinrich H. D. und Oefner, Peter J. (2010) Comparison of serum versus plasma collection in gas chromatography--mass spectrometry-based metabolomics. Electrophoresis 31 (14), S. 2365-2373.

ovarian cancer

Primas, Helga und Kroiss, Regina und Kalteis, Karin und Rappaport, Christine und Muhr, Daniela und Primas, Christian und Kubista, Ernst und Horvat, Reinhard und Oefner, Peter J. und Singer, Christian F. und Wagner, Teresa (2012) Impact of lifestyle factors on preneoplastic changes in prophylactic oophorectomies of BRCA mutation carriers. European journal of cancer prevention : the official journal of the European Cancer Prevention Organisation (ECP) 21 (2), S. 199-204.

Penetrance of BRCA2

Tea, Muy-Kheng M. und Kroiss, Regina und Muhr, Daniela und Fuerhauser-Rappaport, Christine und Oefner, Peter J. und Wagner, Teresa M und Singer, Christian F. (2013) Central European BRCA2 mutation carriers: Birth cohort status correlates with onset of breast cancer. Maturitas.

plasma

Klein, Matthias S. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Sigl, Gregor und Gronwald, Wolfram und Wiedemann, Steffi und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2013) Correlations between milk and plasma levels of amino and carboxylic acids in dairy cows. Journal of Proteome Research 12 (11), S. 5223-5232.

prediction

Ehret, A. und Hochstuhl, D. und Krattenmacher, N. und Tetens, J. und Klein, M. S. und Gronwald, Wolfram und Thaller, G. (2015) Short communication: Use of genomic and metabolic information as well as milk performance records for prediction of subclinical ketosis risk via artificial neural networks. Journal of dairy science 98 (1), S. 322-329.

preneoplastic changes

Primas, Helga und Kroiss, Regina und Kalteis, Karin und Rappaport, Christine und Muhr, Daniela und Primas, Christian und Kubista, Ernst und Horvat, Reinhard und Oefner, Peter J. und Singer, Christian F. und Wagner, Teresa (2012) Impact of lifestyle factors on preneoplastic changes in prophylactic oophorectomies of BRCA mutation carriers. European journal of cancer prevention : the official journal of the European Cancer Prevention Organisation (ECP) 21 (2), S. 199-204.

Primary cells

Dettmer, Katja und Vogl, Franziska C. und Ritter, Axel P. und Zhu, Wentao und Nürnberger, Nadine und Kreutz, Marina und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Gottfried, Eva (2013) Distinct metabolic differences between various human cancer and primary cells. ELECTROPHORESIS 34 (19), S. 2836-2847.

PRMT

Limm, Katharina und Ott, Corinna und Wallner, Susanne und Mueller, Daniel W. und Oefner, Peter J. und Hellerbrand, Claus und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Deregulation of protein methylation in melanoma. European journal of cancer 49 (6), S. 1305-1313.

PROCOS

Fink, Florian (2011) Computational analysis of docked protein-protein complexes. Dissertation, Universität Regensburg

profiling

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics Volume 1 (# 3), S. 253-268.

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics 1 (3), S. 253-268.

prophylactic salpingo-oophorectomy

Primas, Helga und Kroiss, Regina und Kalteis, Karin und Rappaport, Christine und Muhr, Daniela und Primas, Christian und Kubista, Ernst und Horvat, Reinhard und Oefner, Peter J. und Singer, Christian F. und Wagner, Teresa (2012) Impact of lifestyle factors on preneoplastic changes in prophylactic oophorectomies of BRCA mutation carriers. European journal of cancer prevention : the official journal of the European Cancer Prevention Organisation (ECP) 21 (2), S. 199-204.

Protein arginine methylation

Limm, Katharina und Ott, Corinna und Wallner, Susanne und Mueller, Daniel W. und Oefner, Peter J. und Hellerbrand, Claus und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Deregulation of protein methylation in melanoma. European journal of cancer 49 (6), S. 1305-1313.

protein-protein docking

Fink, Florian und Ederer, Stephan und Gronwald, Wolfram (2009) Protein-Protein Interaction Analysis by Docking. Algorithms 2 (1), S. 429-436.

protein-protein-complexes

Fink, Florian (2011) Computational analysis of docked protein-protein complexes. Dissertation, Universität Regensburg

quantification

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics Volume 1 (# 3), S. 253-268.

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics 1 (3), S. 253-268.

Klein, Matthias S. und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) MetaboQuant: a tool combining individual peak calibration and outlier detection for accurate metabolite quantification in 1D (1)H and (1)H-(13)C HSQC NMR spectra. BioTechniques 54 (5), S. 251-256.

Raf kinases

Sanges, C. und Scheuermann, C. und Zahedi, R. P. und Sickmann, A. und Lamberti, A. und Migliaccio, N. und Baljuls, A. und Marra, M. und Zappavigna, S. und Reinders, Jörg und Rapp, U. und Abbruzzese, A. und Caraglia, M. und Arcari, P. (2012) Raf kinases mediate the phosphorylation of eukaryotic translation elongation factor 1A and regulate its stability in eukaryotic cells. Cell Death and Disease 3, e276.

regulatory T cell

Chirasani, Sridhar Reddy und Leukel, Petra und Gottfried, Eva und Hochrein, Jochen und Stadler, Katrin und Neumann, Bernhard und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Bogdahn, Ulrich und Hau, Peter und Kreutz, Marina und Grauer, Oliver M. (2013) Diclofenac inhibits lactate formation and efficiently counteracts local immune suppression in a murine glioma model. International journal of cancer. Journal international du cancer 132 (4), S. 843-53.

Retention crossover

Dettmer, Katja (2014) Assessment of ionic liquid stationary phases for the GC analysis of fatty acid methyl esters. Analytical and Bioanalytical Chemistry 406, S. 4931-4939.

RNAi

Völler, D. und Reinders, Jörg und Meister, Gunter und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Strong reduction of AGO2 expression in melanoma and cellular consequences. British Journal of Cancer 109, S. 3116-3124.

rs11564299

Ruedel, Anke und Stark, Klaus und Kaufmann, Simone und Bauer, Richard und Reinders, Jörg und Rovensky, Jozef und Blazicková, Stanislava und Oefner, Peter J. und Bosserhoff, Anja Katrin (2014) N-cadherin promoter polymorphisms and risk of osteoarthritis. FASEB journal 28 (2), S. 683-691.

scoring

Fink, Florian (2011) Computational analysis of docked protein-protein complexes. Dissertation, Universität Regensburg

Serum

Waldhier, Magdalena Ch. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Gruber, Michael und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2011) Improved enantiomer resolution and quantification of free D-amino acids in serum and urine by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (28), S. 4537-4544.

Dettmer, Katja und Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Nürnberger, Nadine und Schlamberger, Gregor und Gronwald, Wolfram und Meyer, Heinrich H. D. und Oefner, Peter J. (2010) Comparison of serum versus plasma collection in gas chromatography--mass spectrometry-based metabolomics. Electrophoresis 31 (14), S. 2365-2373.

shRNA

Völler, D. und Reinders, Jörg und Meister, Gunter und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Strong reduction of AGO2 expression in melanoma and cellular consequences. British Journal of Cancer 109, S. 3116-3124.

signal transduction

Sanges, C. und Scheuermann, C. und Zahedi, R. P. und Sickmann, A. und Lamberti, A. und Migliaccio, N. und Baljuls, A. und Marra, M. und Zappavigna, S. und Reinders, Jörg und Rapp, U. und Abbruzzese, A. und Caraglia, M. und Arcari, P. (2012) Raf kinases mediate the phosphorylation of eukaryotic translation elongation factor 1A and regulate its stability in eukaryotic cells. Cell Death and Disease 3, e276.

siRNA

Völler, D. und Reinders, Jörg und Meister, Gunter und Bosserhoff, Anja-Katrin (2013) Strong reduction of AGO2 expression in melanoma and cellular consequences. British Journal of Cancer 109, S. 3116-3124.

SOCS1 mutation

Schif, Birgit und Lennerz, Jochen K. und Kohler, Christian und Bentink, Stefan und Kreuz, Markus und Melzner, Ingo und Ritz, Olga und Trümper, Lorenz und Loeffler, Markus und Spang, Rainer und Möller, Peter (2013) SOCS1 mutation subtypes predict divergent outcomes in diffuse large B-Cell lymphoma (DLBCL) patients. Oncotarget 4 (1), S. 35-47.

Spike-in experiment

Almstetter, Martin F. und Appel, Inka und Dettmer, Katja und Gruber, Michael und Oefner, Peter J. (2011) Comparison of two algorithmic data processing strategies for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (39), S. 7031-7038.

Stat3

Chirasani, Sridhar Reddy und Leukel, Petra und Gottfried, Eva und Hochrein, Jochen und Stadler, Katrin und Neumann, Bernhard und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Bogdahn, Ulrich und Hau, Peter und Kreutz, Marina und Grauer, Oliver M. (2013) Diclofenac inhibits lactate formation and efficiently counteracts local immune suppression in a murine glioma model. International journal of cancer. Journal international du cancer 132 (4), S. 843-53.

statistical data analysis

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics Volume 1 (# 3), S. 253-268.

Zacharias, Helena und Hochrein, Jochen und Klein, Matthias S. und Samol, Claudia und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2013) Current Experimental, Bioinformatic and Statistical Methods used in NMR Based Metabolomics. Current Metabolomics 1 (3), S. 253-268.

TLR

Chirasani, Sridhar Reddy und Leukel, Petra und Gottfried, Eva und Hochrein, Jochen und Stadler, Katrin und Neumann, Bernhard und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Bogdahn, Ulrich und Hau, Peter und Kreutz, Marina und Grauer, Oliver M. (2013) Diclofenac inhibits lactate formation and efficiently counteracts local immune suppression in a murine glioma model. International journal of cancer. Journal international du cancer 132 (4), S. 843-53.

transport

Wingenter, Karina und Trentmann, Oliver und Winschuh, Irina und Hörmiller, Imke I und Heyer, Arnd G. und Reinders, Jörg und Schulz, Alexander und Geiger, Dietmar und Hedrich, Rainer und Neuhaus, H. Ekkehard (2011) A member of the mitogen-activated protein 3-kinase family is involved in the regulation of plant vacuolar glucose uptake. The Plant journal 68 (5), S. 890-900.

Tumor cells

Dettmer, Katja und Vogl, Franziska C. und Ritter, Axel P. und Zhu, Wentao und Nürnberger, Nadine und Kreutz, Marina und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram und Gottfried, Eva (2013) Distinct metabolic differences between various human cancer and primary cells. ELECTROPHORESIS 34 (19), S. 2836-2847.

Two-dimensional differential in-gel electrophoresis

Thomas, Anja und Stevens, Axel Peter und Klein, Matthias S. und Hellerbrand, Claus und Dettmer, Katja und Gronwald, Wolfram und Oefner, Peter J. und Reinders, Jörg (2012) Early changes in the liver-soluble proteome from mice fed a nonalcoholic steatohepatitis inducing diet. Proteomics 12 (9), S. 1437-1451.

ubiquitin

Sanges, C. und Scheuermann, C. und Zahedi, R. P. und Sickmann, A. und Lamberti, A. und Migliaccio, N. und Baljuls, A. und Marra, M. und Zappavigna, S. und Reinders, Jörg und Rapp, U. und Abbruzzese, A. und Caraglia, M. und Arcari, P. (2012) Raf kinases mediate the phosphorylation of eukaryotic translation elongation factor 1A and regulate its stability in eukaryotic cells. Cell Death and Disease 3, e276.

Ulcerative Colitis

Vossenkämper, Anna und Hundsrucker, Christian und Page, Kevin und van Maurik, Andre und Sanders, Theodore J. und Stagg, Andrew J. und Das, Lisa und MacDonald, Thomas T. (2014) A CD3-Specific Antibody Reduces Cytokine Production and Alters Phosphoprotein Profiles in Intestinal Tissues From Patients With Inflammatory Bowel Disease. The American Journal of Gastroenterology 147 (1), S. 172-183.

Umfassende 2-dimensionale Gas Chromatographie gekoppelt mit der Flugzeitmassenspektrometrie

Almstetter, Martin F. (2012) Tools and applications for one- and two-dimensional
gas chromatography – time-of-flight mass spectrometry-based metabolomics.
Dissertation, Universität Regensburg

Urine

Waldhier, Magdalena Ch. und Almstetter, Martin F. und Nürnberger, Nadine und Gruber, Michael und Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2011) Improved enantiomer resolution and quantification of free D-amino acids in serum and urine by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (28), S. 4537-4544.

Klein, Matthias S. und Dorn, Christoph und Saugspier, Michael Sebastian und Hellerbrand, Claus und Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2011) Discrimination of steatosis and NASH in mice using nuclear magnetic resonance spectroscopy. Metabolomics 7 (2), S. 237-246.

vacuole

Wingenter, Karina und Trentmann, Oliver und Winschuh, Irina und Hörmiller, Imke I und Heyer, Arnd G. und Reinders, Jörg und Schulz, Alexander und Geiger, Dietmar und Hedrich, Rainer und Neuhaus, H. Ekkehard (2011) A member of the mitogen-activated protein 3-kinase family is involved in the regulation of plant vacuolar glucose uptake. The Plant journal 68 (5), S. 890-900.

verification of protein interactions

Fink, Florian und Ederer, Stephan und Gronwald, Wolfram (2009) Protein-Protein Interaction Analysis by Docking. Algorithms 2 (1), S. 429-436.

Diese Liste wurde erzeugt am Fri Oct 23 05:12:15 2015 CEST.
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