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LoCoLotive: In silico mining for low‐copy nuclear loci based on target capture probe sets and arbitrary reference genomes

URN zum Zitieren dieses Dokuments:
urn:nbn:de:bvb:355-epub-550497
DOI zum Zitieren dieses Dokuments:
10.5283/epub.55049
Lautenschlager, Ulrich ; Scheunert, Agnes
[img]Lizenz: Creative Commons Namensnennung 4.0 International
PDF - Veröffentlichte Version
(416kB)
Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 20 Nov 2023 12:58



Zusammenfassung

Premise Universal target enrichment probe kits are used to circumvent the individual identification of loci suitable for phylogenetic studies in a given taxon. Under certain circumstances, however, target capture can be inefficient and costly, and lower numbers of marker loci may be sufficient. We therefore propose a computational pipeline that enables the easy identification of a subset of ...

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