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miRA: adaptable novel miRNA identification in plants using small RNA sequencing data

URN zum Zitieren dieses Dokuments: urn:nbn:de:bvb:355-epub-328123

Evers, Maurits, Huttner, Michael, Dueck, Anne, Meister, Gunter und Engelmann, Julia C. (2015) miRA: adaptable novel miRNA identification in plants using small RNA sequencing data. BMC Bioinformatics 16 (370), S. 1-10.

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Andere URL zum Volltext: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/370


Zusammenfassung

MicroRNAs (miRNAs) are short regulatory RNAs derived from longer precursor RNAs. miRNA biogenesis has been studied in animals and plants, recently elucidating more complex aspects, such as non-conserved, species-specific, and heterogeneous miRNA precursor populations. Small RNA sequencing data can help in computationally identifying genomic loci of miRNA precursors. The challenge is to predict a ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:5 November 2015
Institutionen:Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Statistische Bioinformatik (Prof. Spang)
Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biochemie, Genetik und Mikrobiologie > Lehrstuhl für Biochemie I > Prof. Dr. Gunter Meister
Projekte:Open Access Publizieren (DFG)
Identifikationsnummer:
WertTyp
26542525PURL
10.1186/s12859-015-0798-3DOI
Stichwörter / Keywords:Sequencing data; miRNA identification; RNA secondary structure; Chlamydomonas reinhardtii ; Small RNA sequencing; Next generation sequencing
Dewey-Dezimal-Klassifikation:000 Informatik, Informationswissenschaft, allgemeine Werke > 004 Informatik
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Eingebracht am:16 Nov 2015 15:14
Zuletzt geändert:08 Mrz 2017 08:39
Dokumenten-ID:32812
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