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An assessment of catalytic residue 3D ensembles for the prediction of enzyme function

Merkl, Rainer, Žváček, Clemens, Heizinger, Leonhard und Friedrichs, Gerald (2015) An assessment of catalytic residue 3D ensembles for the prediction of enzyme function. BMC Bioinformatics 16 (359), S. 1-8.

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Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 14 Dez 2015 09:15

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Andere URL zum Volltext: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/359


Zusammenfassung

Background The central element of each enzyme is the catalytic site, which commonly catalyzes a single biochemical reaction with high specificity. It was unclear to us how often sites that catalyze the same or highly similar reactions evolved on different, i. e. non-homologous protein folds and how similar their 3D poses are. Both similarities are key criteria for assessing the usability of pose ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:4 November 2015
Institutionen:Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Rainer Merkl
Projekte:Open Access Publizieren (DFG)
Identifikationsnummer:
WertTyp
10.1186/s12859-015-0807-6DOI
Stichwörter / Keywords:Catalytic site; Pose comparison; Enzyme function; Enzyme classification
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Dokumenten-ID:33051
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