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Synthesis and properties of new chiral heterocyclic peptide mimetics

URN to cite this document: urn:nbn:de:bvb:355-opus-9365

Maity, Prantik (2008) Synthesis and properties of new chiral heterocyclic peptide mimetics. PhD, Universität Regensburg

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Abstract (English)

The synthesis of tetrahydrofuran C(alpha)-tetrasubstituted amino acids (TAAs) and their effect on the conformation in small peptides are reported. The synthesis starts from the protein amino acid methionine, which is protected at the C and N terminus and converted into the corresponding sulfonium salt by
alkylation. Simple base treatment in the presence of an aryl aldehyde leads to the formation of tetrahydrofuran tetrasubstituted C(alpha)-amino acids in a highly diastereoselective (trans/cis ratio up to 97:3) reaction with moderate to good yields (35-78%) depending on the aldehyde used. Palladium-catalyzed
coupling reactions allow a subsequent further functionalization of the TAA. The R,S,S-TAA-Ala dipeptide amide adopts a beta-turn type I conformation, whereas its S,R,S isomer does not. The R,S,S-Gly-TAA-Ala tripeptide amide shows in the solid state and in solution a conformation of two consecutive beta-turn type
III structures, stabilized by i + 3 to i intramolecular hydrogen bonds.

Translation of the abstract (German)

Die Synthese von tetrahydrofuran C(alpha)-tetrasubstituierten Aminosäuren (TAAs) und ihre Wirkung auf der Anpassung in kleinen Peptiden sind berichtet. Die Synthese fängt von der Eiweiß Aminosäure methionine an, welche am C und dem N Terminus geschützt wird und durch Alkylierung ins entsprechende sulfonium Salz überführt wird. Einfache Basenbehandlung in der Anwesenheit eines Arylaldehydes führt zur Formung von tetrahydrofuran tetrasubstituted C(alpha) Aminosäuren in einer sehr diastereoselektiven (trans/cis Verhältnis bis zu 97:3) Reaktion mit mäßig bis guten Ausbeuten (35-78%) abhängig vom Aldehyd. Pd-katalysierte Kupplungsreaktionen erlauben eine weitere Funktionalisierung der TAA. Das R,S,S-TAA-Ala Dipeptid amide nimmt einen beta-turn an, während sein S,R,S Isomer dies nicht zeigt. Das R,S,S-Gly-TAA-Ala tripeptid amide zeigt im Festkörper und in Lösung eine Konformation von zwei konsekutiven beta-turn Typ III-Strukturen, die durch i+3 zu i intramolekularen Wasserstoffbrücken stabilisiert wird.

Item Type:	Thesis of the University of Regensburg (PhD)
Referee:	Burkhard (Prof. Dr.) König
Date of exam:	18 January 2008
Institutions:	Chemistry and Pharmacy > Institut für Organische Chemie > Lehrstuhl Prof. Dr. Burkhard König
Keywords:	Peptide , Heterocyclische Verbindungen , Chirale Verbindungen , Peptidomimetikum , Chiral , Heterozyklen , peptides , chiral , heterocylces
Subjects:	500 Science > 540 Chemistry & allied sciences
Status:	Published
Refereed:	Yes, this version has been refereed
Created at the University of Regensburg:	Yes
Owner:	Universitätsbibliothek Regensburg
Deposited On:	27 Oct 2009 17:21
Last Modified:	24 Oct 2012 12:30
Item ID:	10723

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