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ReseqChip: automated integration of multiple local context probe data from the MitoChip array in mitochondrial DNA sequence assembly

URN zum Zitieren dieses Dokuments: urn:nbn:de:bvb:355-epub-306621

Thieme, Marian, Lottaz, Claudio, Niederstätter, Harald, Parson, Walther, Spang, Rainer und Oefner, Peter J. (2009) ReseqChip: automated integration of multiple local context probe data from the MitoChip array in mitochondrial DNA sequence assembly. BMC bioinformatics 10, S. 440.

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BACKGROUND: The Affymetrix MitoChip v2.0 is an oligonucleotide tiling array for the resequencing of the human mitochondrial (mt) genome. For each of 16,569 nucleotide positions of the mt genome it holds two sets of four 25-mer probes each that match the heavy and the light strand of a reference mt genome and vary only at their central position to interrogate all four possible alleles. In ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:Dezember 2009
Institutionen:Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Funktionelle Genomik (Prof. Oefner)
Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Statistische Bioinformatik (Prof. Spang)
Identifikationsnummer:
WertTyp
10508508PubMed-ID
10.1186/1471-2105-10-440DOI
Klassifikation:
NotationArt
Base SequenceMESH
Computational Biology/methodsMESH
DNA, Mitochondrial/chemistryMESH
Genome, Mitochondrial/geneticsMESH
Sequence Analysis, DNAMESH
SoftwareMESH
Dewey-Dezimal-Klassifikation:600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Zum Teil
Eingebracht am:18 Aug 2014 09:47
Zuletzt geändert:08 Mrz 2017 08:38
Dokumenten-ID:30662
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