| Lizenz: Veröffentlichungsvertrag für Publikationen mit Print on Demand PDF - Angenommene Version (2MB) |
- URN zum Zitieren dieses Dokuments:
- urn:nbn:de:bvb:355-epub-338524
- DOI zum Zitieren dieses Dokuments:
- 10.5283/epub.33852
| Dokumentenart: | Hochschulschrift der Universität Regensburg (Dissertation) |
|---|---|
| Open Access Art: | Primärpublikation |
| Datum: | 13 Juni 2016 |
| Begutachter (Erstgutachter): | Prof. Dr. Oliver Treeck |
| Tag der Prüfung: | 25 Januar 2016 |
| Institutionen: | Medizin > Lehrstuhl für Frauenheilkunde und Geburtshilfe (Schwerpunkt Frauenheilkunde) |
| Stichwörter / Keywords: | Mammacarcinom, AKR1C3, rs1937845, rs3763676, AKR1C, Östrogenrezeptor, Progesteronrezeptor, PCR, Gelelektrophorese, Allelfrequenz, Genotypfrequenz, Allelpositivität, SNP845, SNP676, Chromosom 10, multiple comparison Analyse |
| Dewey-Dezimal-Klassifikation: | 600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin |
| Status: | Veröffentlicht |
| Begutachtet: | Ja, diese Version wurde begutachtet |
| An der Universität Regensburg entstanden: | Ja |
| Dokumenten-ID: | 33852 |
Zusammenfassung (Deutsch)
Diese Arbeit ist eine Assoziationsstudie zwischen Phänotyp und Genotyp. Der Phänotyp ist hier das Auftreten eines Mammacarcinoms und der Genotyp ist hier die Bestimmung der Allelvarianten zweier SNPs (single nucleotide polymorphisms). Eine Assoziationsstudie liefert einen rein korrelativen Hinweis auf eine eventuell bestehende Signifikanz und kann daher nur deskriptiv, nicht kausal wirken. Die ...
Zusammenfassung (Deutsch)
Diese Arbeit ist eine Assoziationsstudie zwischen Phänotyp und Genotyp. Der Phänotyp ist hier das Auftreten eines Mammacarcinoms und der Genotyp ist hier die Bestimmung der Allelvarianten zweier SNPs (single nucleotide polymorphisms). Eine Assoziationsstudie liefert einen rein korrelativen Hinweis auf eine eventuell bestehende Signifikanz und kann daher nur deskriptiv, nicht kausal wirken.
Die SNPs rs1937845 und rs3763676 (kurz: SNP 845 und SNP 676), welche in dieser Arbeit in Zusammenhang mit dem Mammacarcinom untersucht wurden, sind genregulatorische SNPs und liegen in der Promotorregion des Gens AKR1C3. AKR1C3 katalysiert u.a. Reaktionen im Steroidmetabolismus (hier v.a. Östrogene, Progesterone) und auch im prostaglandin-vermittelten Signalweg mittels NFkappaB (vgl. Abbildungen 4 und 5 in Kapitel 1.3.1). Methodisch angewendet wurde in dieser Arbeit die PCR, dessen Ergebnisse dann in der Gelelektrophorese dargestellt wurden (vgl. Kapitel 2.3 und 2.4).
Diese Arbeit besteht aus zwei Analyseschritten. Im ersten Schritt wurden die Mammacarcinomproben hinsichtlich der beiden oben genannten SNPs bestimmt und dann jeweils mit einer gesunden Kontrollgruppe verglichen. Die Ergebnisse wurden dann statistisch mittels Bestimmung der Odds Ratio und des p-Wertes im 95%-Confidence Interval hinsichtlich der Genotypfrequenz, der Allelfrequenz und der Allelpositivität untersucht. Im ersten Schritt galt es herauszufinden, ob es einen korrelativen Zusammenhang zwischen dem Auftreten oder eben Nichtauftreten eines Mammacarcinoms und der Ausprägung von Allelvarianten (TT, TC, CC) im SNP 845 oder im SNP 676 gibt. Dieses ließ sich statistisch bei beiden SNPs nicht bestätigen (vgl. Kapitel 3.1 bis 3.5).
In einem zweiten Schritt wurden dieselben Analysen hinsichtlich klinisch-pathologischer Parameter, Östrogenstatus (ER), Progesteronstatus (PR), Her2-neu-Ausprägung und Lymphknotenstatus, untersucht. Dazu wurden zum einen Mammacarcinomproben untereinander statistisch untersucht und zum anderen mit den gesunden Proben verglichen. In diesem Schritt der Analyse galt es herauszufinden, ob es einen korrelativen Zusammenhang zwischen dem Auftreten oder eben Nichtauftreten eines bestimmten klinisch-pathologischen Merkmals eines Mammacarcinoms, hinsichtlich von Allelvarianten (TT, TC, CC) im SNP 845 oder im SNP 676, gibt (vgl. Kapitel 3.6). Bei SNP 845 konnte eine statistische Signifikanz erkannt werden. Es konnten insgesamt 6 statistisch relevante Werte ausgemacht werden, welche alle in Bezug zum Fehlen eines Progesteronrezeptorstatus (PR negativ) standen. Dabei ist zu sagen, dass ein negativer Progesteronrezptorstatus mit einem höheren Anteil des T-Allels bzw. mit einem reduzierten Anteil des C-Allels assoziiert ist (vgl. Kapitel 3.7). Bei SNP 676 konnten keine statistisch signifikanten Werte detektiert werden (vgl. Kapitel 3.8).
Anhand dieser statistischen Ergebnisse kann man schlussfolgern, dass SNP 845 keinen Einfluss auf das Mammacarcinomrisiko selbst hat, also auf das Auftreten oder Nichtauftreten dieser Erkrankung, jedoch Einfluss auf die Subgruppenspezifizierung der Mammacarcinomzellen bei bereits erkrankten Personen nimmt. Es besteht daher die Möglichkeit, dass es auch einen kausalen Zusammenhang zwischen dem Progesteronrezeptor-Status und dem SNP 845 gibt. Unterstützt wird diese Annahme dadurch, dass bereits andere, subgruppen-spezifische, mammacarcinom-prädisponierende SNPs detektiert worden sind (vgl. Kapitel 1.2.2). Wie oben schon vermerkt, lässt sich ein Kausalzusammenhang in dieser Assoziationsstudie letzlich jedoch nicht ermitteln.
Übersetzung der Zusammenfassung (Englisch)
This work is an association study between phenotype and genotype. The phenotype is here the occurrence of mammary carcinoma and the genotype is here to determine the allelic variants of two SNPs (single nucleotide polymorphisms). An association study provides a purely correlative indication of any possible existing significance and therefore can only descriptively not act causally. The SNPs ...
Übersetzung der Zusammenfassung (Englisch)
This work is an association study between phenotype and genotype. The phenotype is here the occurrence of mammary carcinoma and the genotype is here to determine the allelic variants of two SNPs (single nucleotide polymorphisms). An association study provides a purely correlative indication of any possible existing significance and therefore can only descriptively not act causally.
The SNPs rs1937845 and rs3763676 (short: SNP 845 and SNP 676), which were studied in this work in the context of the mammary carcinoma, are gene regulatory SNPs and are in the promoter region of the gene AKR1C3. AKR1C3 catalyzes among others Reactions in steroid metabolism (here over all estrogens, progesterone) and the prostaglandin-mediated pathway by NF-kappaB (see Figures 4 and 5 in Section 1.3.1). was applied methodically in this work, the PCR, the results of which were then presented in gel electrophoresis (see section 2.3 and 2.4).
This work consists of two analytical steps. In the first step the mammary carcinoma samples identified with regard to the above two SNPs and then each compared with a healthy control group. The results were then analyzed statistically by the determination of the odds ratio and the p-value in the 95% -Confidence interval with respect to the genotype frequency, the allele frequency and the allele positivity.
The first step was to find out whether there is a correlative relationship between the occurrence or non-occurrence of a newly mammary carcinoma and the expression of allelic variants (TT, TC, CC) in the SNP 845 or SNP 676th This could be statistically at both SNPs not confirm (see section 3.1 to 3.5).
In a second step, the same analyzes regarding clinicopathological parameters, estrogen status (ER), progesterone status (PR), HER2-neu expression and nodal status examined. To do this mammary carcinoma samples were statistically analyzed with each other and with healthy samples.
In this step of the analysis was to find out whether there is a correlative relationship between the occurrence or even non-occurrence of certain clinicopathological feature of mammary carcinoma, in terms of allelic variants (TT, TC, CC) in SNP 845 or SNP 676, are (see section 3.6). In SNP 845 statistical significance could be recognized. There were a total of 6 statistically relevant values are identified, all of which in relation to the absence of progesterone receptor status (PR negative) were.
It is to say that a negative progesterone status is associated with a higher proportion of the T-allele, or with a reduced proportion of the C allele (see FIG. section 3.7). In SNP 676 no statistically significant values were detected (see section 3.8).
Based on these statistical results can be concluded that SNP 845 does not affect the mammary carcinoma risk itself, that means on the occurrence or non-occurrence of the disease, however, influences the clinicopathological feature of mammary carcinoma in already sick people. Therefore, there is the possibility that there is a causal relationship between the progesterone receptor status and the SNP 845th
This assumption is supported by other subgroups-specific, mammary carcinoma predisposing SNPs wich have already been detected (see section 1.2.2). As noted above, a causal link in this association study can ultimately not identify.
Metadaten zuletzt geändert: 25 Nov 2020 22:36
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