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Indirect inference of synergistic and alternative signalling of intracellular pathways

Pirkl, Martin Franz-Xaver (2016) Indirect inference of synergistic and alternative signalling of intracellular pathways. Dissertation, Universität Regensburg.

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Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 27 Jul 2016 08:55

Zusammenfassung (Englisch)

In this work we introduce Boolean Nested Effects Models (B-NEM). B-NEM combines the indirect inference on signalling pathways of the original Nested Effects Models (NEM) with the logical modelling of the CellNet Optimizer. The pathway molecules are called signalling genes (S-genes). These S-genes can be perturbed, e.g. stimulated or inhibited. These perturbations effect the transcription and ...

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Übersetzung der Zusammenfassung (Deutsch)

In dieser Arbeit stellen wir Boolean Nested Effects Models (B-NEM) vor. B-NEM kombiniert die indirekte Inferenz der originalen Nested Effects Models auf Signalwege mit dem logischen Model des CellNet Optimizers. Die Moleküle im Signalweg werden Signalgene (S-gene) genannt. Diese S-gene können beeinflusst werden, z.B. durch Stimulation oder Unterdrückung. Diese Beeinflussung hat Auswirkungen auf ...

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Dokumentenart:Hochschulschrift der Universität Regensburg (Dissertation)
Datum:Juli 2016
Begutachter (Erstgutachter):Prof. Dr. Rainer Spang
Tag der Prüfung:22 Juli 2016
Institutionen:Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Statistische Bioinformatik (Prof. Spang)
Stichwörter / Keywords:signalling, pathway, boolean, logical, nested, effects, models, cancer, hyper-graph, graph, network, propagation, transduction
Dewey-Dezimal-Klassifikation:000 Informatik, Informationswissenschaft, allgemeine Werke > 004 Informatik
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 510 Mathematik
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Dokumenten-ID:34157
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