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Overbeck, Jan H. ; Vögele, Jennifer ; Nussbaumer, Felix ; Duchardt‐Ferner, Elke ; Kreutz, Christoph ; Wöhnert, Jens ; Sprangers, Remco

¹⁹F NMR Untersuchung des Konformationsaustauschs mehrerer Zustände im synthetischen Neomycin‐bindenden Riboschalter

Overbeck, Jan H. , Vögele, Jennifer, Nussbaumer, Felix, Duchardt‐Ferner, Elke, Kreutz, Christoph, Wöhnert, Jens und Sprangers, Remco (2023) ¹⁹F NMR Untersuchung des Konformationsaustauschs mehrerer Zustände im synthetischen Neomycin‐bindenden Riboschalter. Angewandte Chemie 135 (23).

Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 18 Jun 2024 09:42
Artikel
DOI zum Zitieren dieses Dokuments: 10.5283/epub.58451


Zusammenfassung

Der synthetische Neomycin-bindende Riboschalter interagiert mit seinem Liganden Neomycin sowie mit den verwandten Antibiotika Ribostamycin und Paromomycin. Die Bindung dieser Aminoglykoside induziert sehr ähnliche Grundzustandsstrukturen in der RNA, allerdings kann nur Neomycin die Initiierung der Translation effizient unterdrücken. Der molekulare Ursprung dieser Unterschiede wurde auf ...

Der synthetische Neomycin-bindende Riboschalter interagiert mit seinem Liganden Neomycin sowie mit den verwandten Antibiotika Ribostamycin und Paromomycin. Die Bindung dieser Aminoglykoside induziert sehr ähnliche Grundzustandsstrukturen in der RNA, allerdings kann nur Neomycin die Initiierung der Translation effizient unterdrücken. Der molekulare Ursprung dieser Unterschiede wurde auf Unterschiede in der Dynamik der Ligand-Riboschalter-Komplexe zurückgeführt. In diesem Artikel kombinieren wir fünf komplementäre fluorbasierte NMR-Methoden, um die Dynamik der drei Riboschalter-Komplexe im Sekunden- bis Mikrosekundenbereich genau zu quantifizieren. Unsere Daten offenbaren komplexe Austauschprozesse mit bis zu vier strukturell unterschiedlichen Zuständen. Wir interpretieren unsere Ergebnisse in einem Modell, das ein Zusammenspiel zwischen verschiedenen chemischen Gruppen in den Antibiotika und spezifischen Basen im Riboschalter zeigt. Allgemeiner unterstreichen unsere Daten das Potenzial von 19F NMR-Methoden, komplexe Austauschprozesse mit mehreren angeregten Zuständen zu charakterisieren.



Beteiligte Einrichtungen


Details

DokumentenartArtikel
Titel eines Journals oder einer ZeitschriftAngewandte Chemie
Verlag:Wiley
Band:135
Nummer des Zeitschriftenheftes oder des Kapitels:23
Datum27 März 2023
InstitutionenBiologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Remco Sprangers
Identifikationsnummer
WertTyp
10.1002/ange.202218064DOI
Stichwörter / KeywordsAminoglykoside · ¹⁹F NMR · NMR-Spektroskopie · RNA-Dynamik
Dewey-Dezimal-Klassifikation500 Naturwissenschaften und Mathematik > 500 Naturwissenschaften
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
StatusVeröffentlicht
BegutachtetJa, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstandenZum Teil
URN der UB Regensburgurn:nbn:de:bvb:355-epub-584519
Dokumenten-ID58451

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