Direkt zum Inhalt

Overbeck, Jan H. ; Vögele, Jennifer ; Nussbaumer, Felix ; Duchardt‐Ferner, Elke ; Kreutz, Christoph ; Wöhnert, Jens ; Sprangers, Remco

¹⁹F NMR Untersuchung des Konformationsaustauschs mehrerer Zustände im synthetischen Neomycin‐bindenden Riboschalter

Overbeck, Jan H. , Vögele, Jennifer, Nussbaumer, Felix, Duchardt‐Ferner, Elke, Kreutz, Christoph, Wöhnert, Jens and Sprangers, Remco (2023) ¹⁹F NMR Untersuchung des Konformationsaustauschs mehrerer Zustände im synthetischen Neomycin‐bindenden Riboschalter. Angewandte Chemie 135 (23).

Date of publication of this fulltext: 18 Jun 2024 09:42
Article
DOI to cite this document: 10.5283/epub.58451


Abstract

Der synthetische Neomycin-bindende Riboschalter interagiert mit seinem Liganden Neomycin sowie mit den verwandten Antibiotika Ribostamycin und Paromomycin. Die Bindung dieser Aminoglykoside induziert sehr ähnliche Grundzustandsstrukturen in der RNA, allerdings kann nur Neomycin die Initiierung der Translation effizient unterdrücken. Der molekulare Ursprung dieser Unterschiede wurde auf ...

Der synthetische Neomycin-bindende Riboschalter interagiert mit seinem Liganden Neomycin sowie mit den verwandten Antibiotika Ribostamycin und Paromomycin. Die Bindung dieser Aminoglykoside induziert sehr ähnliche Grundzustandsstrukturen in der RNA, allerdings kann nur Neomycin die Initiierung der Translation effizient unterdrücken. Der molekulare Ursprung dieser Unterschiede wurde auf Unterschiede in der Dynamik der Ligand-Riboschalter-Komplexe zurückgeführt. In diesem Artikel kombinieren wir fünf komplementäre fluorbasierte NMR-Methoden, um die Dynamik der drei Riboschalter-Komplexe im Sekunden- bis Mikrosekundenbereich genau zu quantifizieren. Unsere Daten offenbaren komplexe Austauschprozesse mit bis zu vier strukturell unterschiedlichen Zuständen. Wir interpretieren unsere Ergebnisse in einem Modell, das ein Zusammenspiel zwischen verschiedenen chemischen Gruppen in den Antibiotika und spezifischen Basen im Riboschalter zeigt. Allgemeiner unterstreichen unsere Daten das Potenzial von 19F NMR-Methoden, komplexe Austauschprozesse mit mehreren angeregten Zuständen zu charakterisieren.



Involved Institutions


Details

Item typeArticle
Journal or Publication TitleAngewandte Chemie
Publisher:Wiley
Volume:135
Number of Issue or Book Chapter:23
Date27 March 2023
InstitutionsBiology, Preclinical Medicine > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Remco Sprangers
Identification Number
ValueType
10.1002/ange.202218064DOI
KeywordsAminoglykoside · ¹⁹F NMR · NMR-Spektroskopie · RNA-Dynamik
Dewey Decimal Classification500 Science > 500 Natural sciences & mathematics
500 Science > 540 Chemistry & allied sciences
500 Science > 570 Life sciences
StatusPublished
RefereedYes, this version has been refereed
Created at the University of RegensburgPartially
URN of the UB Regensburgurn:nbn:de:bvb:355-epub-584519
Item ID58451

Export bibliographical data

Owner only: item control page

nach oben