| Veröffentlichte Version Download ( PDF | 2MB) | Lizenz: Creative Commons Namensnennung 4.0 International |
¹⁹F NMR Untersuchung des Konformationsaustauschs mehrerer Zustände im synthetischen Neomycin‐bindenden Riboschalter
Overbeck, Jan H.
, Vögele, Jennifer, Nussbaumer, Felix, Duchardt‐Ferner, Elke, Kreutz, Christoph, Wöhnert, Jens und Sprangers, Remco
(2023)
¹⁹F NMR Untersuchung des Konformationsaustauschs mehrerer Zustände im synthetischen Neomycin‐bindenden Riboschalter.
Angewandte Chemie 135 (23).
Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 18 Jun 2024 09:42
Artikel
DOI zum Zitieren dieses Dokuments: 10.5283/epub.58451
Zusammenfassung
Der synthetische Neomycin-bindende Riboschalter interagiert mit seinem Liganden Neomycin sowie mit den verwandten Antibiotika Ribostamycin und Paromomycin. Die Bindung dieser Aminoglykoside induziert sehr ähnliche Grundzustandsstrukturen in der RNA, allerdings kann nur Neomycin die Initiierung der Translation effizient unterdrücken. Der molekulare Ursprung dieser Unterschiede wurde auf ...
Der synthetische Neomycin-bindende Riboschalter interagiert mit seinem Liganden Neomycin sowie mit den verwandten Antibiotika Ribostamycin und Paromomycin. Die Bindung dieser Aminoglykoside induziert sehr ähnliche Grundzustandsstrukturen in der RNA, allerdings kann nur Neomycin die Initiierung der Translation effizient unterdrücken. Der molekulare Ursprung dieser Unterschiede wurde auf Unterschiede in der Dynamik der Ligand-Riboschalter-Komplexe zurückgeführt. In diesem Artikel kombinieren wir fünf komplementäre fluorbasierte NMR-Methoden, um die Dynamik der drei Riboschalter-Komplexe im Sekunden- bis Mikrosekundenbereich genau zu quantifizieren. Unsere Daten offenbaren komplexe Austauschprozesse mit bis zu vier strukturell unterschiedlichen Zuständen. Wir interpretieren unsere Ergebnisse in einem Modell, das ein Zusammenspiel zwischen verschiedenen chemischen Gruppen in den Antibiotika und spezifischen Basen im Riboschalter zeigt. Allgemeiner unterstreichen unsere Daten das Potenzial von 19F NMR-Methoden, komplexe Austauschprozesse mit mehreren angeregten Zuständen zu charakterisieren.
Alternative Links zum Volltext
Beteiligte Einrichtungen
Details
| Dokumentenart | Artikel | ||||
| Titel eines Journals oder einer Zeitschrift | Angewandte Chemie | ||||
| Verlag: | Wiley | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| Band: | 135 | ||||
| Nummer des Zeitschriftenheftes oder des Kapitels: | 23 | ||||
| Datum | 27 März 2023 | ||||
| Institutionen | Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Remco Sprangers | ||||
| Identifikationsnummer |
| ||||
| Stichwörter / Keywords | Aminoglykoside · ¹⁹F NMR · NMR-Spektroskopie · RNA-Dynamik | ||||
| Dewey-Dezimal-Klassifikation | 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 500 Naturwissenschaften 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie | ||||
| Status | Veröffentlicht | ||||
| Begutachtet | Ja, diese Version wurde begutachtet | ||||
| An der Universität Regensburg entstanden | Zum Teil | ||||
| URN der UB Regensburg | urn:nbn:de:bvb:355-epub-584519 | ||||
| Dokumenten-ID | 58451 |
Downloadstatistik
Downloadstatistik