Eigene Vorarbeiten zu diesem Projekt zeigten, daß unsymmetrische Trimethin-Farbstoffe, die oberhalb von 600 nm absorbieren, als diodenlaserkompatible Fluoreszenzmarker für Proteine geeignet sind. Schwächen der bereits bekannten Systeme liegen insbesondere in der Aggregation in wäßrigem Milieu. Damit verbunden ist ein Absinken der Fluoreszenzintensität der Biokonjugate.Erster Schwerpunkt des Projektes ist es, durch Erhöhung der Wasserlöslichkeit die Aggregation in wäßrigem Milieu zu minimieren und gleichzeitig die Fluoreszenz der Chromophorsysteme zu steigern. Dies wird durch Einführung von negativ geladenen Sulfonsäuregruppen in die Farbstoffsysteme erreicht.Proteine und DNA-Oligomere werden dann kovalent mit den optimierten Farbstoffen verknüpft werden. Dabei wird erwartet, daß die zusätzlichen negativen Ladungen der Chromophore unspezifische Wechselwirkungen mit den bei pH 7 ebenfalls negativ geladenen Proteinen bzw. DNA-Fragmenten durch elektrostatische Abstoßung unterbinden.Anschließend werden die fluoreszenzmarkierten Proteine in exemplarischen Immunoassays eingesetzt, und fluoreszente DNA-Oligomere werden in Hybridisierungstests untersucht.
