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A comparative categorization of protein function encoded in bacterial or archeal genomic islands

Merkl, Rainer (2006) A comparative categorization of protein function encoded in bacterial or archeal genomic islands. J Mol Evol 62 (1), S. 1-14.

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Zusammenfassung

Genomes of prokaryotes harbor genomic islands (GIs), which are frequently acquired via horizontal gene transfer (HGT). Here I present an analysis of GIs with respect to gene-encoded functions. GIs were identified by statistical analysis of codon usage and clustering. Genes classified as putatively alien (pA) or putatively native (pN) were categorized according to the COG database. Among pA and pN ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:2006
Institutionen:Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Rainer Merkl
Identifikationsnummer:
WertTyp
16341468PubMed-ID
10.1007/s00239-004-0311-5DOI
Klassifikation:
NotationArt
Amino Acid SequenceMESH
Archaeal Proteins/geneticsMESH
Archaeal Proteins/physiology*MESH
Bacterial Proteins/geneticsMESH
Bacterial Proteins/physiology*MESH
Genomic Islands*MESH
Molecular Sequence DataMESH
PhylogenyMESH
# # Regulatory Elements, TranscriptionalMESH
Stichwörter / Keywords:Genomic islands - Horizontal gene transfer - Lateral gene transfer - Clusters of Orthologous Groups of genes - Xenologous genes
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Eingebracht am:18 Nov 2009 08:41
Zuletzt geändert:24 Mai 2018 11:42
Dokumenten-ID:10923
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