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GO4genome: A prokaryotic phylogeny based on genome organisation

Merkl, Rainer und Wiezer, Arnim (2009) GO4genome: A prokaryotic phylogeny based on genome organisation. Journal of Molecular Evolution 68 (5), S. 550-562.

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Zusammenfassung

Determining the phylogeny of closely related prokaryotes may fail in an analysis of rRNA or a small set of sequences. Whole-genome phylogeny utilizes the maximally available sample space. For a precise determination of genome similarity, two aspects have to be considered when developing an algorithm of whole-genome phylogeny: (1) gene order conservation is a more precise signal than gene content; ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:2009
Institutionen:Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Rainer Merkl
Identifikationsnummer:
WertTyp
19436929PubMed-ID
10.1007/s00239-009-9233-6DOI
Klassifikation:
NotationArt
Algorithms*MESH
Computational Biology/methods*MESH
Escherichia coli/geneticsMESH
Gene OrderMESH
Gene Transfer, HorizontalMESH
Genes, BacterialMESH
Genome, Archaeal/genetics*MESH
Genome, Bacterial/genetics*MESH
Methanosarcina/geneticsMESH
Phylogeny*MESH
Prokaryotic Cells/metabolism*MESH
Streptococcus/geneticsMESH
Yersinia/geneticsMESH
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Zum Teil
Eingebracht am:18 Nov 2009 10:09
Zuletzt geändert:08 Mrz 2017 08:23
Dokumenten-ID:10928
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