Design, synthesis and structural evaluation of peptidomimetics towards foldamers, PNAs and non covalent inhibitors of the 20S proteasome

Item type:	Thesis of the University of Regensburg (PhD)
Date:	6 December 2009
Referee:	Oliver (Prof. Dr.) Reiser
Date of exam:	3 December 2008
Institutions:	Chemistry and Pharmacy > Institut für Organische Chemie > Lehrstuhl Prof. Dr. Oliver Reiser
Keywords:	Peptidomimetikum , CD-Spektroskopie , Chirale Verbindungen , Proteasom , Inhibitor , Peptid-Nucleinsäuren , Proteinfaltung , PNA , Foldamere , Inhibitore , Proteasom , Peptidomimetika , peptidomimetic , foldamer , PNA , non covalent inhibitor , 20S proteasome
Dewey Decimal Classification:	500 Science > 540 Chemistry & allied sciences
Status:	Published
Refereed:	Yes, this version has been refereed
Created at the University of Regensburg:	Yes
Item ID:	12138

Abstract (English)

The first part of the project, which has been done at the university of Regensburg from November 2005 to October 2007, consisted in a stereoselective synthesis of sugar-like delta-amino acid. This amino acid was a suitable building block for the synthesis of an alpha-delta-pentapetide and an alpha-delta-heptapeptide containing a sequence of Phe and our building block. Conformational studies about ...

Abstract (English)

The first part of the project, which has been done at the university of Regensburg from November 2005 to October 2007, consisted in a stereoselective synthesis of sugar-like delta-amino acid. This amino acid was a suitable building block for the synthesis of an alpha-delta-pentapetide and an alpha-delta-heptapeptide containing a sequence of Phe and our building block. Conformational studies about these peptides showed the ability of our building block to induce a secondary structure in the synthesised alpha-delta-peptides, in particular an extended helix structure. In addition, the same furanoic scaffold, has been used for the synthesis of some PNA precursor containing thymine and adenine as nucleobases. The second part of the project, which has been done at the univeristy of Paris Sud from November 2007 to october 2008, consisted in the synthesis of peptidomimetics as non covalent inhibitors of 20S proteasome. Using docking methodology, a small library of molecules were design: the most promising molecules were then synthesised, showing an inhibitory activity of the proteasome in a micromolar range.

Translation of the abstract (German)

Der erste Teil der Arbeit, welcher an der Universität Regensburg durchgeführt wurde (Nov. 2005 bis Okt. 2007), beschäftigte sich mit der stereoselektiven Synthese einer zucker-ähnlichen delta-Aminosäure. Diese Aminosäure stellt einen nützlichen Baustein für die Synthese von Oligopeptiden mit einer bestimmten Sekundärstruktur dar. Des weiteren wurde die o.g. Aminosäure in der Synthese von PNA ...

Translation of the abstract (German)

Der erste Teil der Arbeit, welcher an der Universität Regensburg durchgeführt wurde (Nov. 2005 bis Okt. 2007), beschäftigte sich mit der stereoselektiven Synthese einer zucker-ähnlichen delta-Aminosäure. Diese Aminosäure stellt einen nützlichen Baustein für die Synthese von Oligopeptiden mit einer bestimmten Sekundärstruktur dar. Des weiteren wurde die o.g. Aminosäure in der Synthese von PNA Nukleobasen mit Thymin und Adenin genutzt. Der zweite Teil der Arbeit, welcher an der Universität Paris Sud durchgeführt wurde (Nov. 2007 bis Okt. 2008), beschäftigt sich mit der Synthese von Peptidomimetika als nicht kovalente Inhibitoren des Proteasoms 20S. Mit Hilfe von Docking-Studien wurde eine kleine Bibliothek von Molekülen erstellt. Die aussichtsreichsten Kandidaten wurden synthetisiert und zeigten eine inhibitorische Aktivität im mikromolaren Bereich.

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