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Brusch, Lutz ; Cuniberti, Gianaurelio ; Bertau, Martin

Model evaluation for glycolytic oscillations in yeast biotransformations of xenobiotics

Brusch, Lutz, Cuniberti, Gianaurelio und Bertau, Martin (2004) Model evaluation for glycolytic oscillations in yeast biotransformations of xenobiotics. Biophysical Chemistry 109 (3), S. 413-426.

Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 05 Aug 2009 13:31
Artikel
DOI zum Zitieren dieses Dokuments: 10.5283/epub.1734


Zusammenfassung

Anaerobic glycolysis in yeast perturbed by the reduction of xenobiotic ketones is studied numerically in two models which possess the same topology but different levels of complexity. By comparing both models' predictions for concentrations and fluxes as well as steady or oscillatory temporal behavior we answer the question what phenomena require what kind of minimum model abstraction. While mean ...

Anaerobic glycolysis in yeast perturbed by the reduction of xenobiotic ketones is studied numerically in two models which possess the same topology but different levels of complexity. By comparing both models' predictions for concentrations and fluxes as well as steady or oscillatory temporal behavior we answer the question what phenomena require what kind of minimum model abstraction. While mean concentrations and fluxes are predicted in agreement by both models we observe different domains of oscillatory behavior in parameter space. Generic properties of the glycolytic response to ketones are discussed. (C) 2003 Elsevier B.V. All rights reserved.



Beteiligte Einrichtungen


Details

DokumentenartArtikel
Titel eines Journals oder einer ZeitschriftBiophysical Chemistry
Verlag:ELSEVIER SCIENCE BV
Ort der Veröffentlichung:AMSTERDAM
Band:109
Nummer des Zeitschriftenheftes oder des Kapitels:3
Seitenbereich:S. 413-426
DatumJuni 2004
InstitutionenPhysik > Institut für Theoretische Physik > Entpflichtete oder im Ruhestand befindliche Professoren > Arbeitsgruppe Gianaurelio Cuniberti
Identifikationsnummer
WertTyp
q-bio/0404036arXiv-ID
10.1016/j.bpc.2003.12.004DOI
Stichwörter / KeywordsSACCHAROMYCES-CEREVISIAE; BAKERS-YEAST; BIOCHEMICAL NETWORKS; REDUCTION; DYNAMICS; CALCIUM; ESTERS; GENE; TRANSDUCTION; ENZYMES; glycolysis; metabolic oscillations; model; biotransformation
Dewey-Dezimal-Klassifikation500 Naturwissenschaften und Mathematik > 530 Physik
StatusVeröffentlicht
BegutachtetJa, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstandenJa
URN der UB Regensburgurn:nbn:de:bvb:355-epub-17346
Dokumenten-ID1734

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