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Metabolite extraction from adherently growing mammalian cells for metabolomics studies: optimization of harvesting and extraction protocols

Dettmer, Katja, Nürnberger, Nadine, Kaspar, Hannelore, Gruber, Michael, Almstetter, Martin F. und Oefner, Peter J. (2011) Metabolite extraction from adherently growing mammalian cells for metabolomics studies: optimization of harvesting and extraction protocols. Analytical and bioanalytical chemistry 399 (3), S. 1127-1139.

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Zusammenfassung

Trypsin/ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) treatment and cell scraping in a buffer solution were compared for harvesting adherently growing mammalian SW480 cells for metabolomics studies. In addition, direct scraping with a solvent was tested. Trypsinated and scraped cell pellets were extracted using seven different extraction protocols including pure methanol, methanol/water, pure acetone, ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:Januar 2011
Institutionen:Medizin > Lehrstuhl für Anästhesiologie
Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Funktionelle Genomik (Prof. Oefner)
Identifikationsnummer:
WertTyp
21125262PubMed-ID
10.1007/s00216-010-4425-xDOI
Klassifikation:
NotationArt
2-Propanol/chemistryMESH
Acetone/chemistryMESH
Amino Acids/metabolismMESH
Cell Adhesion/drug effectsMESH
Cell Proliferation/drug effectsMESH
Chloroform/chemistryMESH
Edetic Acid/pharmacologyMESH
Energy Metabolism/drug effectsMESH
Gas Chromatography-Mass SpectrometryMESH
HumansMESH
Methanol/chemistryMESH
Solvents/chemistryMESH
Trypsin/pharmacologyMESH
Tumor Cells, CulturedMESH
Water/chemistryMESH
Stichwörter / Keywords:Metabolomics GC-MS Adherent cells Detachment Extraction Amino acids
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 500 Naturwissenschaften
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Eingebracht am:12 Aug 2014 09:16
Zuletzt geändert:12 Aug 2014 09:16
Dokumenten-ID:30623
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