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Adjusting microbiome profiles for differences in microbial load by spike-in bacteria

URN zum Zitieren dieses Dokuments: urn:nbn:de:bvb:355-epub-339548

Stämmler, Frank, Gläsner, Joachim, Hiergeist, Andreas, Holler, Ernst, Weber, Daniela, Oefner, Peter J., Gessner, Andre und Spang, Rainer (2016) Adjusting microbiome profiles for differences in microbial load by spike-in bacteria. Microbiome 4 (1), S. 28.

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Andere URL zum Volltext: http://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-016-0175-0


Zusammenfassung

Next-generation 16S ribosomal RNA gene sequencing is widely used to determine the relative composition of the mammalian gut microbiomes. However, in the absence of a reference, this does not reveal alterations in absolute abundance of specific operational taxonomic units if microbial loads vary across specimens.


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Dokumentenart:Artikel
Datum:24 Juni 2016
Institutionen:Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Funktionelle Genomik (Prof. Oefner)
Medizin > Lehrstuhl für Innere Medizin III (Hämatologie und Internistische Onkologie)
Medizin > Lehrstuhl für Medizinische Mikrobiologie und Hygiene
Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Statistische Bioinformatik (Prof. Spang)
Projekte:Open Access Publizieren (DFG)
Identifikationsnummer:
WertTyp
10.1186/s40168-016-0175-0DOI
27329048PubMed-ID
Stichwörter / Keywords:16S rRNA gene sequencing; Bacterial communities; Community analysis; Microbial load; Microbiome profiling; Spike-in bacteria; Standardization
Dewey-Dezimal-Klassifikation:600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Eingebracht am:27 Jun 2016 13:30
Zuletzt geändert:08 Mrz 2017 08:40
Dokumenten-ID:33954
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