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A novel approach to remote homology detection: jumping alignments

Spang, Rainer, Rehmsmeier, M. und Stoye, J. (2002) A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology 9 (5), S. 747-760.

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Zusammenfassung

We describe a new algorithm for protein classification and the detection of remote homologs. The rationale is to exploit both vertical and horizontal information of a multiple alignment in a well-balanced manner. This is in contrast to established methods such as profiles and profile hidden Markov models which focus on vertical information as they model the columns of the alignment independently ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:2002
Institutionen:Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Statistische Bioinformatik (Prof. Spang)
Identifikationsnummer:
WertTyp
12487762PubMed-ID
10.1089/106652702761034172DOI
Stichwörter / Keywords:sequence analysis, protein classification, homology detection, jumping alignments
Dewey-Dezimal-Klassifikation:600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Nein
Dokumenten-ID:34402
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