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Harmonization of study and reference data by PhaseLift: saving time when imputing study data

Gorski, M., Winkler, T. W., Stark, K., Müller-Nurasyid, M., Ried, J. S., Grallert, H., Weber, Bernhard H. F. und Heid, Iris M. (2014) Harmonization of study and reference data by PhaseLift: saving time when imputing study data. Genetic Epidemiology 38, S. 381-388.

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Zusammenfassung

Genome-wide association studies are usually accompanied by imputation techniques to complement genome-wide SNP chip genotypes. Current imputation approaches separate the phasing of study data from imputing, which makes the phasing independent from the reference data. The two-step approach allows for updating the imputation for a new reference panel without repeating the tedious phasing step. This ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:2014
Institutionen:Medizin > Lehrstuhl für Humangenetik
Medizin > Abteilung für Nephrologie
Medizin > Institut für Epidemiologie und Präventivmedizin
Identifikationsnummer:
WertTyp
10.1002/gepi.21812DOI
24962562PubMed-ID
Stichwörter / Keywords:1000 Genomes; HapMap; genome-wide association studies; genotype imputation; imputation quality; meta-analysis
Dewey-Dezimal-Klassifikation:600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Dokumenten-ID:35170
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