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Kalbitzer, Hans Robert ; Kreitner, Raphael ; Munte, Claudia E. ; Singer, Katrin ; Stetter, Karl Otto ; Horn, Gudrun ; Kremer, Werner

Complete sequential assignment and secondary structure prediction of the cannulae forming protein CanA from the hyperthermophilic archaeon Pyrodictium abyssi

Kalbitzer, Hans Robert, Kreitner, Raphael, Munte, Claudia E., Singer, Katrin, Stetter, Karl Otto, Horn, Gudrun und Kremer, Werner (2020) Complete sequential assignment and secondary structure prediction of the cannulae forming protein CanA from the hyperthermophilic archaeon Pyrodictium abyssi. Biomolecular NMR Assignments 14, S. 141-146.

Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 05 Feb 2021 08:53
Artikel
DOI zum Zitieren dieses Dokuments: 10.5283/epub.44721


Zusammenfassung

CanA from Pyrodictium abyssi forms a heat-resistant organic hollow-fiber network together with CanB and CanC. An N-terminally truncated construct of CanA (K-1-CanA) gave NMR spectra of good quality that could be assigned by three-dimensional NMR methods on N-15 and C-13-N-15 enriched protein. We assigned the chemical shifts of 96% of all backbone H-1(N) atoms, 98% of all backbone N-15 atoms, 100% ...

CanA from Pyrodictium abyssi forms a heat-resistant organic hollow-fiber network together with CanB and CanC. An N-terminally truncated construct of CanA (K-1-CanA) gave NMR spectra of good quality that could be assigned by three-dimensional NMR methods on N-15 and C-13-N-15 enriched protein. We assigned the chemical shifts of 96% of all backbone H-1(N) atoms, 98% of all backbone N-15 atoms, 100% of all C-13(alpha) atoms, 100% of all H-1(alpha) atoms, 90% of all C-13 ' atoms, and 100% of the C-13(beta) atoms. Two short helices and 10 beta-strands are estimated from an analysis of the chemical shifts leading to a secondary structure content of K-1-CanA of 6% helices, 44% beta-pleated sheets, and 50% coils.



Beteiligte Einrichtungen


Details

DokumentenartArtikel
Titel eines Journals oder einer ZeitschriftBiomolecular NMR Assignments
Verlag:Springer
Ort der Veröffentlichung:DORDRECHT
Band:14
Seitenbereich:S. 141-146
Datum12 Februar 2020
InstitutionenBiologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Dr. Hans Robert Kalbitzer
Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biochemie, Genetik und Mikrobiologie > Lehrstuhl für Mikrobiologie (Archaeenzentrum)
Identifikationsnummer
WertTyp
10.1007/s12104-020-09934-xDOI
Stichwörter / KeywordsNOV; Pyrodictium abyssi; CanA; Cannulae; Extremophile; Solution NMR; Assignments
Dewey-Dezimal-Klassifikation500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
StatusVeröffentlicht
BegutachtetUnbekannt / Keine Angabe
An der Universität Regensburg entstandenJa
URN der UB Regensburgurn:nbn:de:bvb:355-epub-447210
Dokumenten-ID44721

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