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Complete sequential assignment and secondary structure prediction of the cannulae forming protein CanA from the hyperthermophilic archaeon Pyrodictium abyssi
Kalbitzer, Hans Robert, Kreitner, Raphael, Munte, Claudia E., Singer, Katrin, Stetter, Karl Otto, Horn, Gudrun und Kremer, Werner
(2020)
Complete sequential assignment and secondary structure prediction of the cannulae forming protein CanA from the hyperthermophilic archaeon Pyrodictium abyssi.
Biomolecular NMR Assignments 14, S. 141-146.
Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 05 Feb 2021 08:53
Artikel
DOI zum Zitieren dieses Dokuments: 10.5283/epub.44721
Zusammenfassung
CanA from Pyrodictium abyssi forms a heat-resistant organic hollow-fiber network together with CanB and CanC. An N-terminally truncated construct of CanA (K-1-CanA) gave NMR spectra of good quality that could be assigned by three-dimensional NMR methods on N-15 and C-13-N-15 enriched protein. We assigned the chemical shifts of 96% of all backbone H-1(N) atoms, 98% of all backbone N-15 atoms, 100% ...
CanA from Pyrodictium abyssi forms a heat-resistant organic hollow-fiber network together with CanB and CanC. An N-terminally truncated construct of CanA (K-1-CanA) gave NMR spectra of good quality that could be assigned by three-dimensional NMR methods on N-15 and C-13-N-15 enriched protein. We assigned the chemical shifts of 96% of all backbone H-1(N) atoms, 98% of all backbone N-15 atoms, 100% of all C-13(alpha) atoms, 100% of all H-1(alpha) atoms, 90% of all C-13 ' atoms, and 100% of the C-13(beta) atoms. Two short helices and 10 beta-strands are estimated from an analysis of the chemical shifts leading to a secondary structure content of K-1-CanA of 6% helices, 44% beta-pleated sheets, and 50% coils.
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Beteiligte Einrichtungen
Details
| Dokumentenart | Artikel | ||||
| Titel eines Journals oder einer Zeitschrift | Biomolecular NMR Assignments | ||||
| Verlag: | Springer | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| Ort der Veröffentlichung: | DORDRECHT | ||||
| Band: | 14 | ||||
| Seitenbereich: | S. 141-146 | ||||
| Datum | 12 Februar 2020 | ||||
| Institutionen | Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Dr. Hans Robert Kalbitzer Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biochemie, Genetik und Mikrobiologie > Lehrstuhl für Mikrobiologie (Archaeenzentrum) | ||||
| Identifikationsnummer |
| ||||
| Stichwörter / Keywords | NOV; Pyrodictium abyssi; CanA; Cannulae; Extremophile; Solution NMR; Assignments | ||||
| Dewey-Dezimal-Klassifikation | 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie | ||||
| Status | Veröffentlicht | ||||
| Begutachtet | Unbekannt / Keine Angabe | ||||
| An der Universität Regensburg entstanden | Ja | ||||
| URN der UB Regensburg | urn:nbn:de:bvb:355-epub-447210 | ||||
| Dokumenten-ID | 44721 |
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