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Häckl, Martina ; Tauber, Philipp ; Schweda, Frank ; Zacharias, Helena U. ; Altenbuchinger, Michael ; Oefner, Peter J. ; Gronwald, Wolfram

An R-Package for the Deconvolution and Integration of 1D NMR Data: MetaboDecon1D

Häckl, Martina, Tauber, Philipp, Schweda, Frank, Zacharias, Helena U., Altenbuchinger, Michael, Oefner, Peter J. und Gronwald, Wolfram (2021) An R-Package for the Deconvolution and Integration of 1D NMR Data: MetaboDecon1D. Metabolites 11 (7), S. 452.

Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 28 Jul 2021 10:21
Artikel
DOI zum Zitieren dieses Dokuments: 10.5283/epub.46441


Zusammenfassung

NMR spectroscopy is a widely used method for the detection and quantification of metabolites in complex biological fluids. However, the large number of metabolites present in a biological sample such as urine or plasma leads to considerable signal overlap in one-dimensional NMR spectra, which in turn hampers both signal identification and quantification. As a consequence, we have developed an ...

NMR spectroscopy is a widely used method for the detection and quantification of metabolites in complex biological fluids. However, the large number of metabolites present in a biological sample such as urine or plasma leads to considerable signal overlap in one-dimensional NMR spectra, which in turn hampers both signal identification and quantification. As a consequence, we have developed an easy to use R-package that allows the fully automated deconvolution of overlapping signals in the underlying Lorentzian line-shapes. We show that precise integral values are computed, which are required to obtain both relative and absolute quantitative information. The algorithm is independent of any knowledge of the corresponding metabolites, which also allows the quantitative description of features of yet unknown identity.



Beteiligte Einrichtungen


Details

DokumentenartArtikel
Titel eines Journals oder einer ZeitschriftMetabolites
Verlag:MDPI
Ort der Veröffentlichung:BASEL
Band:11
Nummer des Zeitschriftenheftes oder des Kapitels:7
Seitenbereich:S. 452
Datum13 Juli 2021
InstitutionenMedizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Funktionelle Genomik (Prof. Oefner)
Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Physiologie > Prof. Dr. Frank Schweda
Identifikationsnummer
WertTyp
10.3390/metabo11070452DOI
Stichwörter / KeywordsSPECTRA; QUANTIFICATION; SPECTROSCOPY; NMR; 1D; deconvolution; metabolites; quantification; signal identification
Dewey-Dezimal-Klassifikation500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
StatusVeröffentlicht
BegutachtetJa, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstandenZum Teil
URN der UB Regensburgurn:nbn:de:bvb:355-epub-464414
Dokumenten-ID46441

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