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GWAS and colocalization analyses implicate carotid intima-media thickness and carotid plaque loci in cardiovascular outcomes

Franceschini, Nora ; Giambartolomei, Claudia ; de Vries, Paul S. ; Finan, Chris ; Bis, Joshua C. ; Huntley, Rachael P. ; Lovering, Ruth C. ; Tajuddin, Salman M. ; Winkler, Thomas W. ; Graff, Misa ; Kavousi, Maryam ; Dale, Caroline ; Smith, Albert V. ; Hofer, Edith ; van Leeuwen, Elisabeth M. ; Nolte, Ilja M. ; Lu, Lingyi ; Scholz, Markus ; Sargurupremraj, Muralidharan ; Pitkänen, Niina ; Franzén, Oscar ; Joshi, Peter K. ; Noordam, Raymond ; Marioni, Riccardo E. ; Hwang, Shih-Jen ; Musani, Solomon K. ; Schminke, Ulf ; Palmas, Walter ; Isaacs, Aaron ; Correa, Adolfo ; Zonderman, Alan B. ; Hofman, Albert ; Teumer, Alexander ; Cox, Amanda J. ; Uitterlinden, André G. ; Wong, Andrew ; Smit, Andries J. ; Newman, Anne B. ; Britton, Annie ; Ruusalepp, Arno ; Sennblad, Bengt ; Hedblad, Bo ; Pasaniuc, Bogdan ; Penninx, Brenda W. ; Langefeld, Carl D. ; Wassel, Christina L. ; Tzourio, Christophe ; Fava, Cristiano ; Baldassarre, Damiano ; O’Leary, Daniel H. ; Teupser, Daniel ; Kuh, Diana ; Tremoli, Elena ; Mannarino, Elmo ; Grossi, Enzo ; Boerwinkle, Eric ; Schadt, Eric E. ; Ingelsson, Erik ; Veglia, Fabrizio ; Rivadeneira, Fernando ; Beutner, Frank ; Chauhan, Ganesh ; Heiss, Gerardo ; Snieder, Harold ; Campbell, Harry ; Völzke, Henry ; Markus, Hugh S. ; Deary, Ian J. ; Jukema, J. Wouter ; de Graaf, Jacqueline ; Price, Jacqueline ; Pott, Janne ; Hopewell, Jemma C. ; Liang, Jingjing ; Thiery, Joachim ; Engmann, Jorgen ; Gertow, Karl ; Rice, Kenneth ; Taylor, Kent D. ; Dhana, Klodian ; Kiemeney, Lambertus A. L. M. ; Lind, Lars ; Raffield, Laura M. ; Launer, Lenore J. ; Holdt, Lesca M. ; Dörr, Marcus ; Dichgans, Martin ; Traylor, Matthew ; Sitzer, Matthias ; Kumari, Meena ; Kivimaki, Mika ; Nalls, Mike A. ; Melander, Olle ; Raitakari, Olli ; Franco, Oscar H. ; Rueda-Ochoa, Oscar L. ; Roussos, Panos ; Whincup, Peter H. ; Amouyel, Philippe ; Giral, Philippe ; Anugu, Pramod ; Wong, Quenna ; Malik, Rainer ; Rauramaa, Rainer ; Burkhardt, Ralph ; Hardy, Rebecca ; Schmidt, Reinhold ; de Mutsert, Renée ; Morris, Richard W. ; Strawbridge, Rona J. ; Wannamethee, S. Goya ; Hägg, Sara ; Shah, Sonia ; McLachlan, Stela ; Trompet, Stella ; Seshadri, Sudha ; Kurl, Sudhir ; Heckbert, Susan R. ; Ring, Susan ; Harris, Tamara B. ; Lehtimäki, Terho ; Galesloot, Tessel E. ; Shah, Tina ; de Faire, Ulf ; Plagnol, Vincent ; Rosamond, Wayne D. ; Post, Wendy ; Zhu, Xiaofeng ; Zhang, Xiaoling ; Guo, Xiuqing ; Saba, Yasaman ; Dehghan, Abbas ; Seldenrijk, Adrie ; Morrison, Alanna C. ; Hamsten, Anders ; Psaty, Bruce M. ; van Duijn, Cornelia M. ; Lawlor, Deborah A. ; Mook-Kanamori, Dennis O. ; Bowden, Donald W. ; Schmidt, Helena ; Wilson, James F. ; Wilson, James G. ; Rotter, Jerome I. ; Wardlaw, Joanna M. ; Deanfield, John ; Halcox, Julian ; Lyytikäinen, Leo-Pekka ; Loeffler, Markus ; Evans, Michele K. ; Debette, Stéphanie ; Humphries, Steve E. ; Völker, Uwe ; Gudnason, Vilmundur ; Hingorani, Aroon D. ; Björkegren, Johan L. M. ; Casas, Juan P. ; O’Donnell, Christopher J.



Abstract

Carotid artery intima media thickness (cIMT) and carotid plaque are measures of subclinical atherosclerosis associated with ischemic stroke and coronary heart disease (CHD). Here, we undertake meta-analyses of genome-wide association studies (GWAS) in 71,128 individuals for cIMT, and 48,434 individuals for carotid plaque traits. We identify eight novel susceptibility loci for cIMT, one ...

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