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Protein-altering variants associated with body mass index implicate pathways that control energy intake and expenditure in obesity

Turcot, Valérie ; Lu, Yingchang ; Highland, Heather M. ; Schurmann, Claudia ; Justice, Anne E. ; Fine, Rebecca S. ; Bradfield, Jonathan P. ; Esko, Tõnu ; Giri, Ayush ; Graff, Mariaelisa ; Guo, Xiuqing ; Hendricks, Audrey E. ; Karaderi, Tugce ; Lempradl, Adelheid ; Locke, Adam E. ; Mahajan, Anubha ; Marouli, Eirini ; Sivapalaratnam, Suthesh ; Young, Kristin L. ; Alfred, Tamuno ; Feitosa, Mary F. ; Masca, Nicholas G. D. ; Manning, Alisa K. ; Medina-Gomez, Carolina ; Mudgal, Poorva ; Ng, Maggie C. Y. ; Reiner, Alex P. ; Vedantam, Sailaja ; Willems, Sara M. ; Winkler, Thomas W. ; Abecasis, Gonçalo ; Aben, Katja K. ; Alam, Dewan S. ; Alharthi, Sameer E. ; Allison, Matthew ; Amouyel, Philippe ; Asselbergs, Folkert W. ; Auer, Paul L. ; Balkau, Beverley ; Bang, Lia E. ; Barroso, Inês ; Bastarache, Lisa ; Benn, Marianne ; Bergmann, Sven ; Bielak, Lawrence F. ; Blüher, Matthias ; Boehnke, Michael ; Boeing, Heiner ; Boerwinkle, Eric ; Böger, Carsten A. ; Bork-Jensen, Jette ; Bots, Michiel L. ; Bottinger, Erwin P. ; Bowden, Donald W. ; Brandslund, Ivan ; Breen, Gerome ; Brilliant, Murray H. ; Broer, Linda ; Brumat, Marco ; Burt, Amber A. ; Butterworth, Adam S. ; Campbell, Peter T. ; Cappellani, Stefania ; Carey, David J. ; Catamo, Eulalia ; Caulfield, Mark J. ; Chambers, John C. ; Chasman, Daniel I. ; Chen, Yii-Der I. ; Chowdhury, Rajiv ; Christensen, Cramer ; Chu, Audrey Y. ; Cocca, Massimiliano ; Collins, Francis S. ; Cook, James P. ; Corley, Janie ; Corominas Galbany, Jordi ; Cox, Amanda J. ; Crosslin, David S. ; Cuellar-Partida, Gabriel ; D’Eustacchio, Angela ; Danesh, John ; Davies, Gail ; Bakker, Paul I. W. ; Groot, Mark C. H. ; de Mutsert, Renée ; Deary, Ian J. ; Dedoussis, George ; Demerath, Ellen W. ; Heijer, Martin ; Hollander, Anneke I. ; Ruijter, Hester M. ; Dennis, Joe G. ; Denny, Josh C. ; Di Angelantonio, Emanuele ; Drenos, Fotios ; Du, Mengmeng ; Dubé, Marie-Pierre ; Dunning, Alison M. ; Easton, Douglas F. ; Edwards, Todd L. ; Ellinghaus, David ; Ellinor, Patrick T. ; Elliott, Paul ; Evangelou, Evangelos ; Farmaki, Aliki-Eleni ; Farooqi, I. Sadaf ; Faul, Jessica D. ; Fauser, Sascha ; Feng, Shuang ; Ferrannini, Ele ; Ferrieres, Jean ; Florez, Jose C. ; Ford, Ian ; Fornage, Myriam ; Franco, Oscar H. ; Franke, Andre ; Franks, Paul W. ; Friedrich, Nele ; Frikke-Schmidt, Ruth ; Galesloot, Tessel E. ; Gan, Wei ; Gandin, Ilaria ; Gasparini, Paolo ; Gibson, Jane ; Giedraitis, Vilmantas ; Gjesing, Anette P. ; Gordon-Larsen, Penny ; Gorski, Mathias ; Grabe, Hans-Jörgen ; Grant, Struan F. A. ; Grarup, Niels ; Griffiths, Helen L. ; Grove, Megan L. ; Gudnason, Vilmundur ; Gustafsson, Stefan ; Haessler, Jeff ; Hakonarson, Hakon ; Hammerschlag, Anke R. ; Hansen, Torben ; Harris, Kathleen Mullan ; Harris, Tamara B. ; Hattersley, Andrew T. ; Have, Christian T. ; Hayward, Caroline ; He, Liang ; Heard-Costa, Nancy L. ; Heath, Andrew C. ; Heid, Iris M. ; Helgeland, Øyvind ; Hernesniemi, Jussi ; Hewitt, Alex W. ; Holmen, Oddgeir L. ; Hovingh, G. Kees ; Howson, Joanna M. M. ; Hu, Yao ; Huang, Paul L. ; Huffman, Jennifer E. ; Ikram, M. Arfan ; Ingelsson, Erik ; Jackson, Anne U. ; Jansson, Jan-Håkan ; Jarvik, Gail P. ; Jensen, Gorm B. ; Jia, Yucheng ; Johansson, Stefan ; Jørgensen, Marit E. ; Jørgensen, Torben ; Jukema, J. Wouter ; Kahali, Bratati ; Kahn, René S. ; Kähönen, Mika ; Kamstrup, Pia R. ; Kanoni, Stavroula ; Kaprio, Jaakko ; Karaleftheri, Maria ; Kardia, Sharon L. R. ; Karpe, Fredrik ; Kathiresan, Sekar ; Kee, Frank ; Kiemeney, Lambertus A. ; Kim, Eric ; Kitajima, Hidetoshi ; Komulainen, Pirjo ; Kooner, Jaspal S. ; Kooperberg, Charles ; Korhonen, Tellervo ; Kovacs, Peter ; Kuivaniemi, Helena ; Kutalik, Zoltán ; Kuulasmaa, Kari ; Kuusisto, Johanna ; Laakso, Markku ; Lakka, Timo A. ; Lamparter, David ; Lange, Ethan M. ; Lange, Leslie A. ; Langenberg, Claudia ; Larson, Eric B. ; Lee, Nanette R. ; Lehtimäki, Terho ; Lewis, Cora E. ; Li, Huaixing ; Li, Jin ; Li-Gao, Ruifang ; Lin, Honghuang ; Lin, Keng-Hung ; Lin, Li-An ; Lin, Xu ; Lind, Lars ; Lindström, Jaana ; Linneberg, Allan ; Liu, Ching-Ti ; Liu, Dajiang J. ; Liu, Yongmei ; Lo, Ken S. ; Lophatananon, Artitaya ; Lotery, Andrew J. ; Loukola, Anu ; Luan, Jian’an ; Lubitz, Steven A. ; Lyytikäinen, Leo-Pekka ; Männistö, Satu ; Marenne, Gaëlle ; Mazul, Angela L. ; McCarthy, Mark I. ; McKean-Cowdin, Roberta ; Medland, Sarah E. ; Meidtner, Karina ; Milani, Lili ; Mistry, Vanisha ; Mitchell, Paul ; Mohlke, Karen L. ; Moilanen, Leena ; Moitry, Marie ; Montgomery, Grant W. ; Mook-Kanamori, Dennis O. ; Moore, Carmel ; Mori, Trevor A. ; Morris, Andrew D. ; Morris, Andrew P. ; Müller-Nurasyid, Martina ; Munroe, Patricia B. ; Nalls, Mike A. ; Narisu, Narisu ; Nelson, Christopher P. ; Neville, Matt ; Nielsen, Sune F. ; Nikus, Kjell ; Njølstad, Pål R. ; Nordestgaard, Børge G. ; Nyholt, Dale R. ; O’Connel, Jeffrey R. ; O’Donoghue, Michelle L. ; Olde Loohuis, Loes M. ; Ophoff, Roel A. ; Owen, Katharine R. ; Packard, Chris J. ; Padmanabhan, Sandosh ; Palmer, Colin N. A. ; Palmer, Nicholette D. ; Pasterkamp, Gerard ; Patel, Aniruddh P. ; Pattie, Alison ; Pedersen, Oluf ; Peissig, Peggy L. ; Peloso, Gina M. ; Pennell, Craig E. ; Perola, Markus ; Perry, James A. ; Perry, John R. B. ; Pers, Tune H. ; Person, Thomas N. ; Peters, Annette ; Petersen, Eva R. B. ; Peyser, Patricia A. ; Pirie, Ailith ; Polasek, Ozren ; Polderman, Tinca J. ; Puolijoki, Hannu ; Raitakari, Olli T. ; Rasheed, Asif ; Rauramaa, Rainer ; Reilly, Dermot F. ; Renström, Frida ; Rheinberger, Myriam ; Ridker, Paul M. ; Rioux, John D. ; Rivas, Manuel A. ; Roberts, David J. ; Robertson, Neil R. ; Robino, Antonietta ; Rolandsson, Olov ; Rudan, Igor ; Ruth, Katherine S. ; Saleheen, Danish ; Salomaa, Veikko ; Samani, Nilesh J. ; Sapkota, Yadav ; Sattar, Naveed ; Schoen, Robert E. ; Schreiner, Pamela J. ; Schulze, Matthias B. ; Scott, Robert A. ; Segura-Lepe, Marcelo P. ; Shah, Svati H. ; Sheu, Wayne H.-H. ; Sim, Xueling ; Slater, Andrew J. ; Small, Kerrin S. ; Smith, Albert V. ; Southam, Lorraine ; Spector, Timothy D. ; Speliotes, Elizabeth K. ; Starr, John M. ; Stefansson, Kari ; Steinthorsdottir, Valgerdur ; Stirrups, Kathleen E. ; Strauch, Konstantin ; Stringham, Heather M. ; Stumvoll, Michael ; Sun, Liang ; Surendran, Praveen ; Swift, Amy J. ; Tada, Hayato ; Tansey, Katherine E. ; Tardif, Jean-Claude ; Taylor, Kent D. ; Teumer, Alexander ; Thompson, Deborah J. ; Thorleifsson, Gudmar ; Thorsteinsdottir, Unnur ; Thuesen, Betina H. ; Tönjes, Anke ; Tromp, Gerard ; Trompet, Stella ; Tsafantakis, Emmanouil ; Tuomilehto, Jaakko ; Tybjaerg-Hansen, Anne ; Tyrer, Jonathan P. ; Uher, Rudolf ; Uitterlinden, André G. ; Uusitupa, Matti ; Laan, Sander W. ; Duijn, Cornelia M. ; Leeuwen, Nienke ; van Setten, Jessica ; Vanhala, Mauno ; Varbo, Anette ; Varga, Tibor V. ; Varma, Rohit ; Velez Edwards, Digna R. ; Vermeulen, Sita H. ; Veronesi, Giovanni ; Vestergaard, Henrik ; Vitart, Veronique ; Vogt, Thomas F. ; Völker, Uwe ; Vuckovic, Dragana ; Wagenknecht, Lynne E. ; Walker, Mark ; Wallentin, Lars ; Wang, Feijie ; Wang, Carol A. ; Wang, Shuai ; Wang, Yiqin ; Ware, Erin B. ; Wareham, Nicholas J. ; Warren, Helen R. ; Waterworth, Dawn M. ; Wessel, Jennifer ; White, Harvey D. ; Willer, Cristen J. ; Wilson, James G. ; Witte, Daniel R. ; Wood, Andrew R. ; Wu, Ying ; Yaghootkar, Hanieh ; Yao, Jie ; Yao, Pang ; Yerges-Armstrong, Laura M. ; Young, Robin ; Zeggini, Eleftheria ; Zhan, Xiaowei ; Zhang, Weihua ; Zhao, Jing Hua ; Zhao, Wei ; Zhao, Wei ; Zhou, Wei ; Zondervan, Krina T ; Rotter, Jerome I. ; Pospisilik, John A. ; Rivadeneira, Fernando ; Borecki, Ingrid B. ; Deloukas, Panos ; Frayling, Timothy M. ; Lettre, Guillaume ; North, Kari E. ; Lindgren, Cecilia M. ; Hirschhorn, Joel N. ; Loos, Ruth J. F.



Abstract

Genome-wide association studies (GWAS) have identified >250 loci for body mass index (BMI), implicating pathways related to neuronal biology. Most GWAS loci represent clusters of common, noncoding variants from which pinpointing causal genes remains challenging. Here we combined data from 718,734 individuals to discover rare and low-frequency (minor allele frequency (MAF) < 5%) coding variants ...

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