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The metabolic network coherence of human transcriptomes is associated with genetic variation at the cadherin 18 locus

Schlicht, Kristina ; Nyczka, Piotr ; Caliebe, Amke ; Freitag-Wolf, Sandra ; Claringbould, Annique ; Franke, Lude ; Võsa, Urmo ; Kardia, Sharon L. R. ; Smith, Jennifer A. ; Zhao, Wei ; Gieger, Christian ; Peters, Annette ; Prokisch, Holger ; Strauch, Konstantin ; Baurecht, Hansjörg ; Weidinger, Stephan ; Rosenstiel, Philip ; Hütt, Marc-Thorsten ; Knecht, Carolin ; Szymczak, Silke ; Krawczak, Michael



Zusammenfassung

Metabolic coherence (MC) is a network-based approach to dimensionality reduction that can be used, for example, to interpret the joint expression of genes linked to human metabolism. Computationally, the derivation of transcriptomic' MC involves mapping of an individual gene expression profile onto a gene-centric network derived beforehand from a metabolic network (currently Recon2), followed by ...

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