Software JimenaE allows efficient dynamic simulations of Boolean networks, centrality and system state analysis

URN zum Zitieren dieses Dokuments:: urn:nbn:de:bvb:355-epub-550652
DOI zum Zitieren dieses Dokuments:: 10.5283/epub.55065

Kaltdorf, Martin ; Breitenbach, Tim ; Karl, Stefan ; Fuchs, Maximilian ; Kessie, David Komla ; Psota, Eric ; Prelog, Martina ; Sarukhanyan, Edita ; Ebert, Regina ; Jakob, Franz ; Dandekar, Gudrun ; Naseem, Muhammad ; Liang, Chunguang ; Dandekar, Thomas

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Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 21 Nov 2023 15:20

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The signal modelling framework JimenaE simulates dynamically Boolean networks. In contrast to SQUAD, there is systematic and not just heuristic calculation of all system states. These specific features are not present in CellNetAnalyzer and BoolNet. JimenaE is an expert extension of Jimena, with new optimized code, network conversion into different formats, rapid convergence both for system state ...

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