Massenspektrometrie von Proteinen

In Zusammenarbeit mit verschiedenen SFB-Projekten werden Methoden der quantitativen Massenspektrometrie wie z.B. SILAC, iTRAQ, Label-free angewendet und die entsprechenden Workflows für unser Bruker MaXis plus UHR-QTOF Massenspektrometer weiter optimiert. Zusätzlich wird Selected Reaction Monitoring (SRM) als hochsensitiver gerichteter Ansatz für die relative und absolute Quantifizierung von Proteinen und posttranslationalen Modifikationen eingesetzt. Außerdem sollen neue massenspektrometrische Methoden wie z.B. Data-Independent Acquisition (DIA) für die quantitative Proteomanalyse sowie Top-Down Proteomik für die Analyse von Proteoformen implementiert werden.