Kompositorische und funktionelle Analyse von rRNA Gen-Chromatin in bestimmten transkriptionellen Zuständen

In der neuen Antragsperiode werden wir ein System zur Isolierung von RNA Polymerase (Pol) I transkribiertem episomalen Chromatin nutzen. Das episomale Chromatin wird in etablierten und komplementären ex vivo und in vivo Ansätzen untersucht. Wir haben zwei Hauptforschungsziele:(i) Die Analyse von Struktur-Funktionsbeziehungen des Pol I Präinitiationskomplexes (PIC). Im Speziellen wollen wir die Mechanismen verstehen, die zur PIC Assemblierung führen.(ii) Die molekulare Charakterisierung des „offenen“ Pol I transkribierten Chromatinzustandes sowie der Mechanismen, die zu dessen Etablierung führen.Um unsere Ziele zu erreichen werden wir eng mit Projekt AP1 zusammenarbeiten, was eine vergleichende Analyse von in vitro rekonstituiertem und in vivo assembliertem Pol I PIC ermöglichen wird. In Zusammenarbeit mit Projekt A1 erwarten wir weitere Einblicke in die Mechanismen der Pol I Transkription im nativen Chromatinkontext. Wir denken, dass diese Analysen zu einem besseren Verständnis der Wechselbeziehung zwischen Chromatinstruktur und dem Prozess der Transkription im Zellkern von Eukaryoten führen werden.