Wie ermitteln die „Decapping“ Enzyme DcpS und Dcp2 die Länge des mRNA Subtrates?

Während des mRNA-Abbaus entfernen die Dcp2 und DcpS Enzyme die schützende 5'-mRNA Cap-Struktur von dem Transkript. Das Substrat für beide Enzyme ist mRNA mit einer 5’ Cap Struktur. Allerdings ist Dcp2 bei langen Transkripten am aktivsten, während DcpS nur bei kurzen Transkripten aktiv ist. Hier werden wir genaue mRNA-Decapping Experimente mit verschiedenen biophysikalischen Methoden kombinieren, um die strukturellen Grundlagen für die „molekularen Lineale“ innerhalb der Dcp2- und DcpS-Enzyme aufzuklären. Außerdem werden wir darauf eingehen, wie die Substratspezifitäten dieser Enzyme durch Wechselwirkungen mit Decappingfaktoren und durch zelluläre Phasentrennungen, die zur Bildung zellulärer Processing Bodies führen, reguliert werden. Unsere Erkenntnisse haben wichtige Implikationen, da das fehlerhafte Decapping eines mRNA-Substrats zu einer erheblichen Deregulierung der Genexpression führen würde.