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A survey of codon and amino acid frequency bias in microbial genomes focusing on translational efficiency

Merkl, Rainer (2003) A survey of codon and amino acid frequency bias in microbial genomes focusing on translational efficiency. Journal of Molecular Evolution 57, S. 453-466.

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Zusammenfassung

Unequal use of synonymous codons has been found in several prokaryotic and eukaryotic genomes. This bias has been associated with translational efficiency. The prevalence of this bias across lineages is currently unknown. Here, a new method (GCB) to measure codon usage bias is presented. It uses an iterative approach for the determination of codon scores and allows the computation of an index of ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:2003
Institutionen:Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Rainer Merkl
Identifikationsnummer:
WertTyp
14708578PubMed-ID
10.1007/s00239-003-2499-1DOI
Klassifikation:
NotationArt
Amino Acids/genetics*MESH
Bacteria/geneticsMESH
Codon/genetics*MESH
Genome, Bacterial*MESH
Genome, Fungal*MESH
Molecular Sequence DataMESH
Saccharomyces cerevisiae/geneticsMESH
Translations*MESH
Stichwörter / Keywords:Translational efficiency - Codon usage bias - Major codons - Interspecies comparison
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Nein
Eingebracht am:18 Nov 2009 09:52
Zuletzt geändert:08 Mrz 2017 08:23
Dokumenten-ID:10920
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