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AMIGOS: a method for the inspection of genomic organisation or structure and its application to characterise and dissect conserved gene arrangements

Merkl, Rainer (2006) AMIGOS: a method for the inspection of genomic organisation or structure and its application to characterise and dissect conserved gene arrangements. In Silico Biology 6, 0027.

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Zusammenfassung

In order to identify and to characterise gene clusters conserved in microbial genomes, the algorithm AMIGOS was developed. It is based on a categorisation of genes using a predefined set of gene functions (GFs). After the categorisation of all genes of a genome and based on their location on a replicon, distances between GFs were determined and stored in genome-specific matrices. These matrices ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:2006
Institutionen:Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Rainer Merkl
Identifikationsnummer:
WertTyp
16922692PubMed-ID
Klassifikation:
NotationArt
Algorithms*MESH
ClassificationMESH
Cluster AnalysisMESH
Conserved SequenceMESH
Databases, GeneticMESH
Escherichia coli/geneticsMESH
Genetics, Microbial/methods*MESH
Genetics, Microbial/statistics & numerical dataMESH
Genome, ArchaealMESH
Genome, BacterialMESH
Genomics/methods*MESH
Genomics/statistics & numerical dataMESH
Multigene FamilyMESH
OperonMESH
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Eingebracht am:18 Nov 2009 09:43
Zuletzt geändert:08 Mrz 2017 08:23
Dokumenten-ID:10922
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