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H2r: Identification of evolutionary important residues by means of an entropy based analysis of multiple sequence alignments

URN zum Zitieren dieses Dokuments: urn:nbn:de:bvb:355-epub-109291

Merkl, Rainer und Zwick, Matthias (2007) H2r: Identification of evolutionary important residues by means of an entropy based analysis of multiple sequence alignments. BMC Bioinformatics 9, S. 151.

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Zusammenfassung

BACKGROUND: A multiple sequence alignment (MSA) generated for a protein can be used to characterise residues by means of a statistical analysis of single columns. In addition to the examination of individual positions, the investigation of co-variation of amino acid frequencies offers insights into function and evolution of the protein and residues. RESULTS: We introduce conn(k), a novel ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:2007
Institutionen:Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Rainer Merkl
Identifikationsnummer:
WertTyp
18366663PubMed-ID
10.1186/1471-2105-9-151DOI
Klassifikation:
NotationArt
Algorithms*MESH
Amino Acid SequenceMESH
Base SequenceMESH
EntropyMESH
Evolution, Molecular*MESH
Molecular Sequence DataMESH
Proteins/chemistry*MESH
Proteins/genetics*MESH
Sequence Alignment/methods*MESH
Sequence Analysis, DNA/methods*MESH
Sequence Analysis, Protein/methods*MESH
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Zum Teil
Eingebracht am:18 Nov 2009 10:04
Zuletzt geändert:08 Mrz 2017 08:23
Dokumenten-ID:10929
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