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Integrative normalization and comparative analysis for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry

Almstetter, Martin F., Appel, Inka, Gruber, Michael, Lottaz, Claudio, Timischl, Birgit, Spang, Rainer, Dettmer, Katja und Oefner, Peter J. (2009) Integrative normalization and comparative analysis for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Analytical chemistry 81 (14), S. 5731-5739.

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Zusammenfassung

Comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry (GC x GC-TOF-MS) was applied to the comparative metabolic fingerprinting of a wild-type versus a double mutant strain of Escherichia coli lacking the transhydrogenases UdhA and PntAB. Using peak lists generated with the Leco ChromaTOF software as input, we developed retention time correction and data alignment tools ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:Juli 2009
Institutionen:Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Funktionelle Genomik (Prof. Oefner)
Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Statistische Bioinformatik (Prof. Spang)
Identifikationsnummer:
WertTyp
19522528PubMed-ID
10.1021/ac900528bDOI
Klassifikation:
NotationArt
Automatic Data ProcessingMESH
Chromatography, GasMESH
Escherichia coli/metabolismMESH
Linear ModelsMESH
Mass SpectrometryMESH
Metabolomics/methodsMESH
MutationMESH
NADP/metabolismMESH
NADP Transhydrogenases/metabolismMESH
Principal Component AnalysisMESH
Reproducibility of ResultsMESH
Time FactorsMESH
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Eingebracht am:19 Aug 2014 07:27
Zuletzt geändert:25 Mai 2018 13:15
Dokumenten-ID:30665
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