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Colomb, Julien ; Reiter, Lutz ; Blaszkiewicz, Jedrzej ; Wessnitzer, Jan ; Brembs, Björn

Software schematics

Colomb, Julien, Reiter, Lutz, Blaszkiewicz, Jedrzej, Wessnitzer, Jan und Brembs, Björn (2012) Software schematics. [Bild]

Veröffentlichungsdatum dieses Volltextes: 07 Apr 2015 10:23
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DOI zum Zitieren dieses Dokuments: 10.5283/epub.31602


Zusammenfassung

The experimenter enters information (in red) about the fly and the platform (semi-automatically) into the tracker application (BuriTrack). The tracker saves this information along with a time stamp in an XML file. Online analysis of the video leads to the extraction of the position of the fly over time, which is directly saved to the data file. The analysis software (CeTrAn) then reads a text ...

The experimenter enters information (in red) about the fly and the platform (semi-automatically) into the tracker application (BuriTrack). The tracker saves this information along with a time stamp in an XML file. Online analysis of the video leads to the extraction of the position of the fly over time, which is directly saved to the data file. The analysis software (CeTrAn) then reads a text file indicating the path to the XML file and the fly grouping information. It then automatically imports the data, transforms it into an easily workable class of data (ltraj) and performs the analyses following different variables the experimenter can set (in red). As outputs, CeTrAn writes R workspaces (before and after the analysis), a csv file of the computed parameters and pdf files where those metrics are plotted against the group factor.



Beteiligte Einrichtungen


Verknüpfung von Datensätzen

Details

DokumentenartBild
Titel eines Journals oder einer ZeitschriftPLoS ONE
Verlag:PubMed Central
Band:7
Nummer des Zeitschriftenheftes oder des Kapitels:8
Seitenbereich:e42247
Datum9 August 2012
InstitutionenBiologie und Vorklinische Medizin > Institut für Zoologie > Neurogenetik (Prof. Dr. Björn Brembs)
Identifikationsnummer
WertTyp
10.1371/journal.pone.0042247.g002DOI
Stichwörter / KeywordsComputational biology, neuroscience, computer science
Dewey-Dezimal-Klassifikation500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 590 Tiere (Zoologie)
StatusVeröffentlicht
BegutachtetJa, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstandenNein
URN der UB Regensburgurn:nbn:de:bvb:355-epub-316029
Dokumenten-ID31602

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