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Novel Approach Identifies SNPs in SLC2A10 and KCNK9 with Evidence for Parent-of-Origin Effect on Body Mass Index

Visscher, Peter M. ; Hoggart, Clive J. ; Venturini, Giulia ; Mangino, Massimo ; Gomez, Felicia ; Ascari, Giulia ; Zhao, Jing Hua ; Teumer, Alexander ; Winkler, Thomas W. ; Tšernikova, Natalia ; Luan, Jian'an ; Mihailov, Evelin ; Ehret, Georg B. ; Zhang, Weihua ; Lamparter, David ; Esko, Tõnu ; Macé, Aurelien ; Rüeger, Sina ; Bochud, Pierre-Yves ; Barcella, Matteo ; Dauvilliers, Yves ; Benyamin, Beben ; Evans, David M. ; Hayward, Caroline ; Lopez, Mary F. ; Franke, Lude ; Russo, Alessia ; Heid, Iris M. ; Salvi, Erika ; Vendantam, Sailaja ; Arking, Dan E. ; Boerwinkle, Eric ; Chambers, John C. ; Fiorito, Giovanni ; Grallert, Harald ; Guarrera, Simonetta ; Homuth, Georg ; Huffman, Jennifer E. ; Porteous, David ; Moradpour, Darius ; Iranzo, Alex ; Hebebrand, Johannes ; Kemp, John P. ; Lammers, Gert J. ; Aubert, Vincent ; Heim, Markus H. ; Martin, Nicholas G. ; Montgomery, Grant W. ; Peraita-Adrados, Rosa ; Santamaria, Joan ; Negro, Francesco ; Schmidt, Carsten O. ; Scott, Robert A. ; Spector, Tim D. ; Strauch, Konstantin ; Völzke, Henry ; Wareham, Nicholas J. ; Yuan, Wei ; Bell, Jordana T. ; Chakravarti, Aravinda ; Kooner, Jaspal S. ; Peters, Annette ; Matullo, Giuseppe ; Wallaschofski, Henri ; Whitfield, John B. ; Paccaud, Fred ; Vollenweider, Peter ; Bergmann, Sven ; Beckmann, Jacques S. ; Tafti, Mehdi ; Hastie, Nicholas D. ; Cusi, Daniele ; Bochud, Murielle ; Frayling, Timothy M. ; Metspalu, Andres ; Jarvelin, Marjo-Riitta ; Scherag, André ; Smith, George Davey ; Borecki, Ingrid B. ; Rousson, Valentin ; Hirschhorn, Joel N. ; Rivolta, Carlo ; Loos, Ruth J. F. ; Kutalik, Zoltán



Zusammenfassung

The phenotypic effect of some single nucleotide polymorphisms (SNPs) depends on their parental origin. We present a novel approach to detect parent-of-origin effects (POEs) in genome-wide genotype data of unrelated individuals. The method exploits increased phenotypic variance in the heterozygous genotype group relative to the homozygous groups. We applied the method to >56,000 unrelated ...

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