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TransCent: computational enzyme design by transferring active sites and considering constraints relevant for catalysis

URN zum Zitieren dieses Dokuments: urn:nbn:de:bvb:355-epub-109075

Fischer, André, Enkler, Nils, Neudert, Gerd, Bocola, Marco, Sterner, Reinhard und Merkl, Rainer (2009) TransCent: computational enzyme design by transferring active sites and considering constraints relevant for catalysis. BMC Bioinformatics 10, S. 54.

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Zusammenfassung

BACKGROUND: Computational enzyme design is far from being applicable for the general case. Due to computational complexity and limited knowledge of the structure-function interplay, heuristic methods have to be used. RESULTS: We have developed TransCent, a computational enzyme design method supporting the transfer of active sites from one enzyme to an alternative scaffold. In an optimization ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:2009
Institutionen:Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Rainer Merkl
Biologie und Vorklinische Medizin > Institut für Biophysik und physikalische Biochemie > Prof. Dr. Reinhard Sterner
Identifikationsnummer:
WertTyp
19208235PubMed-ID
10.1186/1471-2105-10-54DOI
Klassifikation:
NotationArt
Amino Acid SequenceMESH
Binding SitesMESH
CatalysisMESH
Catalytic Domain*MESH
Computational Biology/methods*MESH
Databases, ProteinMESH
Enzymes/chemistry*MESH
LigandsMESH
Models, MolecularMESH
Molecular Sequence DataMESH
Protein ConformationMESH
Sequence AlignmentMESH
Structure-Activity RelationshipMESH
Stichwörter / Keywords:Amino Acid Sequence Binding Sites Catalysis *Catalytic Domain Computational Biology/*methods Databases, Protein Enzymes/*chemistry Ligands Models, Molecular Molecular Sequence Data Protein Conformation Sequence Alignment Structure-Activity Relationship
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Eingebracht am:18 Nov 2009 09:58
Zuletzt geändert:08 Mrz 2017 08:23
Dokumenten-ID:10907
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