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Comparison of two algorithmic data processing strategies for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry

Almstetter, Martin F., Appel, Inka, Dettmer, Katja, Gruber, Michael und Oefner, Peter J. (2011) Comparison of two algorithmic data processing strategies for metabolic fingerprinting by comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry. Journal of chromatography A 1218 (39), S. 7031-7038.

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Zusammenfassung

The alignment algorithm Statistical Compare (SC) developed by LECO Corporation for the processing of comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry (GC×GC-TOFMS) data was validated and compared to the in-house developed retention time correction and data alignment tool INCA (Integrative Normalization and Comparative Analysis) by a spike-in experiment and the ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:September 2011
Institutionen:Medizin > Lehrstuhl für Anästhesiologie
Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Funktionelle Genomik (Prof. Oefner)
Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Statistische Bioinformatik (Prof. Spang)
Identifikationsnummer:
WertTyp
21871627PubMed-ID
10.1016/j.chroma.2011.08.006DOI
Klassifikation:
NotationArt
AlgorithmsMESH
Data MiningMESH
Escherichia coli/metabolismMESH
Escherichia coli Proteins/metabolismMESH
Gas Chromatography-Mass Spectrometry/methodsMESH
Metabolome/physiologyMESH
Metabolomics/methodsMESH
Multivariate AnalysisMESH
Principal Component AnalysisMESH
ROC CurveMESH
SoftwareMESH
Stichwörter / Keywords:Alignment; Data mining; GC × GC–TOFMS; Metabolic fingerprinting; Metabolomics; Spike-in experiment
Dewey-Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik > 500 Naturwissenschaften
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Eingebracht am:12 Aug 2014 09:14
Zuletzt geändert:18 Jan 2016 15:21
Dokumenten-ID:30621
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