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Scale-Invariant Biomarker Discovery in Urine and Plasma Metabolite Fingerprints

Zacharias, Helena, Rehberg, Thorsten, Mehrl, S., Richtmann, D., Wettig, Tilo, Oefner, Peter J. , Spang, Rainer, Gronwald, Wolfram und Altenbuchinger, Michael (2017) Scale-Invariant Biomarker Discovery in Urine and Plasma Metabolite Fingerprints. J. Proteome Res..

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Zusammenfassung

Metabolomics data is typically scaled to a common reference like a constant volume of body fluid, a constant creatinine level, or a constant area under the spectrum. Such scaling of the data, however, may affect the selection of biomarkers and the biological interpretation of results in unforeseen ways. Here, we studied how both the outcome of hypothesis tests for differential metabolite ...

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Dokumentenart:Artikel
Datum:21 August 2017
Institutionen:Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Funktionelle Genomik (Prof. Oefner)
Medizin > Institut für Funktionelle Genomik > Lehrstuhl für Statistische Bioinformatik (Prof. Spang)
Identifikationsnummer:
WertTyp
28825821PubMed-ID
10.1021/acs.jproteome.7b00325DOI
Stichwörter / Keywords:LASSO; NMR; metabolomics; normalization; scaling; zero-sum
Dewey-Dezimal-Klassifikation:600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften > 610 Medizin
Status:Veröffentlicht
Begutachtet:Ja, diese Version wurde begutachtet
An der Universität Regensburg entstanden:Ja
Dokumenten-ID:36205
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