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Kaltdorf, Martin, Breitenbach, Tim, Karl, Stefan, Fuchs, Maximilian, Kessie, David Komla, Psota, Eric, Prelog, Martina, Sarukhanyan, Edita, Ebert, Regina, Jakob, Franz, Dandekar, Gudrun, Naseem, Muhammad, Liang, Chunguang und Dandekar, Thomas (2023) Software JimenaE allows efficient dynamic simulations of Boolean networks, centrality and system state analysis. Scientific Reports 13 (1).

Förster, Frank, Beisser, Daniela, Grohme, Markus A., Liang, Chunguang, Mali, Brahim, Siegl, Alexander Matthias, Engelmann, Julia C., Shkumatov, Alexander V., Schokraie, Elham, Müller, Tobias, Schnölzer, Martina, Schill, Ralph O., Frohme, Marcus und Dandekar, Thomas (2012) Transcriptome analysis in tardigrade species reveals specific molecular pathways for stress adaptations. Bioinformatics and biology insights 6, S. 69-96.

Förster, Frank, Liang, Chunguang, Shkumatov, Alexander V., Beisser, Daniela, Engelmann, Julia C., Schnölzer, Martina, Frohme, Marcus, Müller, Tobias, Schill, Ralph O. und Dandekar, Thomas (2009) Tardigrade workbench: comparing stress-related proteins, sequence-similar and functional protein clusters as well as RNA elements in tardigrades. BMC genomics 10, S. 469.

Engelmann, Julia C., Rahmann, Sven, Wolf, Matthias, Schultz, Jörg, Fritzilas, Epameinondas, Kneitz, Susanne, Dandekar, Thomas und Müller, Tobias (2009) Modelling cross-hybridization on phylogenetic DNA microarrays increases the detection power of closely related species. Molecular ecology resources 9 (1), S. 83-93. Volltext nicht vorhanden.

Engelmann, Julia C., Schwarz, Roland, Blenk, Steffen, Friedrich, Torben, Seibel, Philipp N., Dandekar, Thomas und Müller, Tobias (2008) Unsupervised meta-analysis on diverse gene expression datasets allows insight into gene function and regulation. Bioinformatics and biology insights 2, S. 265-280.

Blenk, Steffen, Engelmann, Julia C., Pinkert, Stefan, Weniger, Markus, Schultz, Jörg, Rosenwald, Andreas, Müller-Hermelink, Hans K., Müller, Tobias und Dandekar, Thomas (2008) Explorative data analysis of MCL reveals gene expression networks implicated in survival and prognosis supported by explorative CGH analysis. BMC cancer 8, S. 106.

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